Protein–RNA interactions for Protein: P19123

Tnnc1, Troponin C, slow skeletal and cardiac muscles, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnc1P19123 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tnnc1P19123 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tnnc1P19123 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tnnc1P19123 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Tnnc1P19123 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tnnc1P19123 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tnnc1P19123 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tnnc1P19123 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tnnc1P19123 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tnnc1P19123 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tnnc1P19123 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tnnc1P19123 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tnnc1P19123 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tnnc1P19123 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tnnc1P19123 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tnnc1P19123 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tnnc1P19123 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Tnnc1P19123 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Tnnc1P19123 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Tnnc1P19123 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tnnc1P19123 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tnnc1P19123 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tnnc1P19123 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tnnc1P19123 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Tnnc1P19123 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Tnnc1P19123 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Tnnc1P19123 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Tnnc1P19123 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Tnnc1P19123 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Tnnc1P19123 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Tnnc1P19123 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Tnnc1P19123 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Tnnc1P19123 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Tnnc1P19123 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Tnnc1P19123 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Tnnc1P19123 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tnnc1P19123 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tnnc1P19123 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tnnc1P19123 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tnnc1P19123 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tnnc1P19123 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tnnc1P19123 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tnnc1P19123 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tnnc1P19123 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tnnc1P19123 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tnnc1P19123 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Tnnc1P19123 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Tnnc1P19123 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tnnc1P19123 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tnnc1P19123 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tnnc1P19123 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tnnc1P19123 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Tnnc1P19123 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tnnc1P19123 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tnnc1P19123 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Tnnc1P19123 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tnnc1P19123 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Tnnc1P19123 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tnnc1P19123 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tnnc1P19123 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tnnc1P19123 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tnnc1P19123 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tnnc1P19123 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tnnc1P19123 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tnnc1P19123 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tnnc1P19123 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tnnc1P19123 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tnnc1P19123 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tnnc1P19123 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tnnc1P19123 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tnnc1P19123 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tnnc1P19123 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tnnc1P19123 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tnnc1P19123 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tnnc1P19123 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tnnc1P19123 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tnnc1P19123 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tnnc1P19123 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tnnc1P19123 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Tnnc1P19123 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tnnc1P19123 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tnnc1P19123 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tnnc1P19123 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tnnc1P19123 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tnnc1P19123 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tnnc1P19123 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tnnc1P19123 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tnnc1P19123 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Tnnc1P19123 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Tnnc1P19123 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tnnc1P19123 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tnnc1P19123 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tnnc1P19123 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tnnc1P19123 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tnnc1P19123 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tnnc1P19123 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tnnc1P19123 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tnnc1P19123 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tnnc1P19123 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tnnc1P19123 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms