Protein–RNA interactions for Protein: P18527

Ig heavy chain V region 914, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18527 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P18527 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P18527 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P18527 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
P18527 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P18527 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P18527 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P18527 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P18527 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P18527 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P18527 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P18527 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
P18527 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P18527 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P18527 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P18527 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P18527 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P18527 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
P18527 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P18527 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
P18527 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P18527 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P18527 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P18527 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P18527 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P18527 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P18527 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P18527 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
P18527 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P18527 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P18527 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P18527 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P18527 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
P18527 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
P18527 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P18527 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P18527 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P18527 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P18527 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
P18527 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
P18527 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
P18527 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
P18527 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
P18527 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
P18527 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
P18527 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
P18527 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
P18527 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
P18527 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
P18527 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
P18527 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
P18527 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
P18527 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
P18527 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
P18527 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
P18527 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
P18527 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
P18527 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
P18527 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
P18527 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
P18527 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
P18527 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
P18527 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
P18527 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
P18527 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
P18527 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
P18527 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
P18527 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
P18527 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
P18527 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
P18527 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
P18527 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
P18527 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
P18527 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
P18527 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
P18527 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
P18527 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
P18527 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
P18527 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
P18527 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
P18527 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
P18527 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
P18527 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
P18527 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
P18527 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
P18527 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
P18527 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
P18527 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
P18527 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
P18527 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
P18527 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
P18527 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
P18527 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
P18527 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
P18527 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
P18527 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
P18527 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
P18527 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
P18527 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
P18527 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms