Protein–RNA interactions for Protein: P17918

Pcna, Proliferating cell nuclear antigen, mousemouse

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcnaP17918 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PcnaP17918 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PcnaP17918 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PcnaP17918 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PcnaP17918 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PcnaP17918 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PcnaP17918 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PcnaP17918 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PcnaP17918 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PcnaP17918 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PcnaP17918 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PcnaP17918 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PcnaP17918 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PcnaP17918 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PcnaP17918 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PcnaP17918 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PcnaP17918 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PcnaP17918 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PcnaP17918 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PcnaP17918 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PcnaP17918 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PcnaP17918 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PcnaP17918 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PcnaP17918 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PcnaP17918 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PcnaP17918 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PcnaP17918 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PcnaP17918 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PcnaP17918 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PcnaP17918 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PcnaP17918 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PcnaP17918 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PcnaP17918 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PcnaP17918 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PcnaP17918 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PcnaP17918 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PcnaP17918 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PcnaP17918 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PcnaP17918 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PcnaP17918 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PcnaP17918 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PcnaP17918 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PcnaP17918 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PcnaP17918 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PcnaP17918 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PcnaP17918 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PcnaP17918 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PcnaP17918 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PcnaP17918 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PcnaP17918 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PcnaP17918 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PcnaP17918 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PcnaP17918 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PcnaP17918 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PcnaP17918 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PcnaP17918 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PcnaP17918 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PcnaP17918 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PcnaP17918 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PcnaP17918 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PcnaP17918 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PcnaP17918 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PcnaP17918 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PcnaP17918 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PcnaP17918 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PcnaP17918 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PcnaP17918 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PcnaP17918 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PcnaP17918 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PcnaP17918 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PcnaP17918 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PcnaP17918 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PcnaP17918 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PcnaP17918 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PcnaP17918 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PcnaP17918 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PcnaP17918 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PcnaP17918 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PcnaP17918 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PcnaP17918 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PcnaP17918 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PcnaP17918 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PcnaP17918 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PcnaP17918 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PcnaP17918 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PcnaP17918 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PcnaP17918 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PcnaP17918 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PcnaP17918 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PcnaP17918 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PcnaP17918 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PcnaP17918 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PcnaP17918 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PcnaP17918 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PcnaP17918 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PcnaP17918 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PcnaP17918 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PcnaP17918 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PcnaP17918 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PcnaP17918 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.6 ms