Protein–RNA interactions for Protein: P16546

Sptan1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptan1P16546 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sptan1P16546 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sptan1P16546 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sptan1P16546 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sptan1P16546 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sptan1P16546 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sptan1P16546 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sptan1P16546 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sptan1P16546 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sptan1P16546 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sptan1P16546 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sptan1P16546 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Sptan1P16546 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sptan1P16546 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Sptan1P16546 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Sptan1P16546 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sptan1P16546 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sptan1P16546 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sptan1P16546 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sptan1P16546 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sptan1P16546 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sptan1P16546 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sptan1P16546 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Sptan1P16546 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sptan1P16546 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sptan1P16546 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sptan1P16546 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sptan1P16546 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sptan1P16546 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sptan1P16546 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Sptan1P16546 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sptan1P16546 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sptan1P16546 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sptan1P16546 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sptan1P16546 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sptan1P16546 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sptan1P16546 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sptan1P16546 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sptan1P16546 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sptan1P16546 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sptan1P16546 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sptan1P16546 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sptan1P16546 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sptan1P16546 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sptan1P16546 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sptan1P16546 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sptan1P16546 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sptan1P16546 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sptan1P16546 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sptan1P16546 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sptan1P16546 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sptan1P16546 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sptan1P16546 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sptan1P16546 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sptan1P16546 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sptan1P16546 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sptan1P16546 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sptan1P16546 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sptan1P16546 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sptan1P16546 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sptan1P16546 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Sptan1P16546 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sptan1P16546 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sptan1P16546 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sptan1P16546 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sptan1P16546 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sptan1P16546 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sptan1P16546 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sptan1P16546 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sptan1P16546 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sptan1P16546 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sptan1P16546 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sptan1P16546 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sptan1P16546 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sptan1P16546 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sptan1P16546 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sptan1P16546 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sptan1P16546 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sptan1P16546 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sptan1P16546 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sptan1P16546 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sptan1P16546 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sptan1P16546 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sptan1P16546 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sptan1P16546 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Sptan1P16546 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sptan1P16546 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sptan1P16546 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Sptan1P16546 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sptan1P16546 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sptan1P16546 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Sptan1P16546 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sptan1P16546 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sptan1P16546 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sptan1P16546 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Sptan1P16546 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Sptan1P16546 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Sptan1P16546 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Sptan1P16546 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Sptan1P16546 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
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