Protein–RNA interactions for Protein: P15919

Rag1, V(D)J recombination-activating protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,040 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rag1P15919 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rag1P15919 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rag1P15919 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Rag1P15919 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rag1P15919 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rag1P15919 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rag1P15919 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rag1P15919 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rag1P15919 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rag1P15919 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rag1P15919 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rag1P15919 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rag1P15919 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rag1P15919 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rag1P15919 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rag1P15919 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rag1P15919 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rag1P15919 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Rag1P15919 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rag1P15919 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rag1P15919 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rag1P15919 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rag1P15919 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rag1P15919 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rag1P15919 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rag1P15919 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rag1P15919 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rag1P15919 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rag1P15919 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rag1P15919 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rag1P15919 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rag1P15919 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rag1P15919 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rag1P15919 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rag1P15919 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rag1P15919 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rag1P15919 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rag1P15919 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rag1P15919 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rag1P15919 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rag1P15919 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rag1P15919 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Rag1P15919 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rag1P15919 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rag1P15919 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rag1P15919 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rag1P15919 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rag1P15919 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Rag1P15919 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Rag1P15919 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Rag1P15919 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rag1P15919 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rag1P15919 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rag1P15919 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rag1P15919 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rag1P15919 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rag1P15919 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rag1P15919 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Rag1P15919 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Rag1P15919 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rag1P15919 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rag1P15919 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rag1P15919 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rag1P15919 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rag1P15919 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rag1P15919 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rag1P15919 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rag1P15919 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rag1P15919 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rag1P15919 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rag1P15919 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rag1P15919 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rag1P15919 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rag1P15919 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rag1P15919 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rag1P15919 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rag1P15919 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rag1P15919 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rag1P15919 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rag1P15919 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rag1P15919 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rag1P15919 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rag1P15919 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rag1P15919 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rag1P15919 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rag1P15919 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rag1P15919 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rag1P15919 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rag1P15919 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rag1P15919 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rag1P15919 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rag1P15919 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rag1P15919 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rag1P15919 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rag1P15919 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rag1P15919 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rag1P15919 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rag1P15919 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rag1P15919 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rag1P15919 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms