Protein–RNA interactions for Protein: P14576

Srp54, Signal recognition particle 54 kDa protein, mousemouse

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Length 504 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp54P14576 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Srp54P14576 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Srp54P14576 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Srp54P14576 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Srp54P14576 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Srp54P14576 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Srp54P14576 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Srp54P14576 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Srp54P14576 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Srp54P14576 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Srp54P14576 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Srp54P14576 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Srp54P14576 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Srp54P14576 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Srp54P14576 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Srp54P14576 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Srp54P14576 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Srp54P14576 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Srp54P14576 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Srp54P14576 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Srp54P14576 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Srp54P14576 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Srp54P14576 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Srp54P14576 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Srp54P14576 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Srp54P14576 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Srp54P14576 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Srp54P14576 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Srp54P14576 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Srp54P14576 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Srp54P14576 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Srp54P14576 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Srp54P14576 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Srp54P14576 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Srp54P14576 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Srp54P14576 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Srp54P14576 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Srp54P14576 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Srp54P14576 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Srp54P14576 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Srp54P14576 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Srp54P14576 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Srp54P14576 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Srp54P14576 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Srp54P14576 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Srp54P14576 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Srp54P14576 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Srp54P14576 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Srp54P14576 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Srp54P14576 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Srp54P14576 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Srp54P14576 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Srp54P14576 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Srp54P14576 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Srp54P14576 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Srp54P14576 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Srp54P14576 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Srp54P14576 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Srp54P14576 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Srp54P14576 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Srp54P14576 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Srp54P14576 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Srp54P14576 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Srp54P14576 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Srp54P14576 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Srp54P14576 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Srp54P14576 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Srp54P14576 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Srp54P14576 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Srp54P14576 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Srp54P14576 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Srp54P14576 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Srp54P14576 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Srp54P14576 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Srp54P14576 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Srp54P14576 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Srp54P14576 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Srp54P14576 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Srp54P14576 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Srp54P14576 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Srp54P14576 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Srp54P14576 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Srp54P14576 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Srp54P14576 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Srp54P14576 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Srp54P14576 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Srp54P14576 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Srp54P14576 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Srp54P14576 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Srp54P14576 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Srp54P14576 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Srp54P14576 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Srp54P14576 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Srp54P14576 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Srp54P14576 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Srp54P14576 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Srp54P14576 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Srp54P14576 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms