Protein–RNA interactions for Protein: P13373

Vpreb2, Immunoglobulin omega chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb2P13373 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Vpreb2P13373 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Vpreb2P13373 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Vpreb2P13373 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Vpreb2P13373 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Vpreb2P13373 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Vpreb2P13373 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Vpreb2P13373 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Vpreb2P13373 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Vpreb2P13373 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Vpreb2P13373 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Vpreb2P13373 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Vpreb2P13373 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Vpreb2P13373 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Vpreb2P13373 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Vpreb2P13373 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Vpreb2P13373 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Vpreb2P13373 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Vpreb2P13373 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Vpreb2P13373 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Vpreb2P13373 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Vpreb2P13373 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Vpreb2P13373 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Vpreb2P13373 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Vpreb2P13373 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Vpreb2P13373 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Vpreb2P13373 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Vpreb2P13373 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Vpreb2P13373 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Vpreb2P13373 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Vpreb2P13373 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Vpreb2P13373 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Vpreb2P13373 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Vpreb2P13373 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Vpreb2P13373 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Vpreb2P13373 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Vpreb2P13373 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Vpreb2P13373 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Vpreb2P13373 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Vpreb2P13373 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Vpreb2P13373 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vpreb2P13373 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vpreb2P13373 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vpreb2P13373 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vpreb2P13373 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vpreb2P13373 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vpreb2P13373 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vpreb2P13373 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vpreb2P13373 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vpreb2P13373 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vpreb2P13373 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vpreb2P13373 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vpreb2P13373 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vpreb2P13373 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vpreb2P13373 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vpreb2P13373 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vpreb2P13373 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vpreb2P13373 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vpreb2P13373 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vpreb2P13373 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vpreb2P13373 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vpreb2P13373 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vpreb2P13373 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vpreb2P13373 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vpreb2P13373 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vpreb2P13373 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vpreb2P13373 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vpreb2P13373 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vpreb2P13373 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vpreb2P13373 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vpreb2P13373 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vpreb2P13373 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vpreb2P13373 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vpreb2P13373 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vpreb2P13373 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vpreb2P13373 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vpreb2P13373 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vpreb2P13373 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vpreb2P13373 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vpreb2P13373 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vpreb2P13373 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vpreb2P13373 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vpreb2P13373 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vpreb2P13373 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vpreb2P13373 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vpreb2P13373 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Vpreb2P13373 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Vpreb2P13373 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Vpreb2P13373 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Vpreb2P13373 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Vpreb2P13373 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Vpreb2P13373 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Vpreb2P13373 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Vpreb2P13373 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Vpreb2P13373 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Vpreb2P13373 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Vpreb2P13373 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Vpreb2P13373 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Vpreb2P13373 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Vpreb2P13373 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms