Protein–RNA interactions for Protein: P12657

Chrm1, Muscarinic acetylcholine receptor M1, mousemouse

Predictions only

Length 460 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrm1P12657 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Chrm1P12657 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Chrm1P12657 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Chrm1P12657 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Chrm1P12657 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Chrm1P12657 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Chrm1P12657 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Chrm1P12657 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Chrm1P12657 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Chrm1P12657 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Chrm1P12657 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Chrm1P12657 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Chrm1P12657 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Chrm1P12657 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Chrm1P12657 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Chrm1P12657 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Chrm1P12657 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Chrm1P12657 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Chrm1P12657 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Chrm1P12657 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Chrm1P12657 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Chrm1P12657 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Chrm1P12657 CT025525.2-201ENSMUST00000227743 423 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Chrm1P12657 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Chrm1P12657 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Chrm1P12657 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Chrm1P12657 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Chrm1P12657 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Chrm1P12657 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Chrm1P12657 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Chrm1P12657 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Chrm1P12657 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Chrm1P12657 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Chrm1P12657 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Chrm1P12657 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Chrm1P12657 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Chrm1P12657 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Chrm1P12657 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Chrm1P12657 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Chrm1P12657 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Chrm1P12657 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Chrm1P12657 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Chrm1P12657 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Chrm1P12657 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Chrm1P12657 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Chrm1P12657 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Chrm1P12657 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Chrm1P12657 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Chrm1P12657 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Chrm1P12657 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Chrm1P12657 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Chrm1P12657 Fam24a-202ENSMUST00000207439 711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Chrm1P12657 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Chrm1P12657 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Chrm1P12657 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Chrm1P12657 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Chrm1P12657 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Chrm1P12657 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Chrm1P12657 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Chrm1P12657 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Chrm1P12657 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Chrm1P12657 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Chrm1P12657 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Chrm1P12657 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Chrm1P12657 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Chrm1P12657 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Chrm1P12657 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Chrm1P12657 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Chrm1P12657 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Chrm1P12657 Gm37648-201ENSMUST00000192072 2563 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Chrm1P12657 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Chrm1P12657 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Chrm1P12657 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Chrm1P12657 Gm13571-201ENSMUST00000124654 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Chrm1P12657 Asb11-201ENSMUST00000033755 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Chrm1P12657 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Chrm1P12657 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Chrm1P12657 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Chrm1P12657 Cgrrf1-203ENSMUST00000133989 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Chrm1P12657 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Chrm1P12657 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Chrm1P12657 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Chrm1P12657 Ap1g1-206ENSMUST00000179104 1096 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Chrm1P12657 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Chrm1P12657 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Chrm1P12657 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Chrm1P12657 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Chrm1P12657 Gm34272-201ENSMUST00000208886 253 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Chrm1P12657 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Chrm1P12657 Olfr1447-201ENSMUST00000071484 1113 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Chrm1P12657 Olfr1446-201ENSMUST00000081236 1044 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Chrm1P12657 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Chrm1P12657 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Chrm1P12657 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Chrm1P12657 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Chrm1P12657 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Chrm1P12657 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Chrm1P12657 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Chrm1P12657 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Chrm1P12657 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms