Protein–RNA interactions for Protein: P11369

Pol, LINE-1 retrotransposable element ORF2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PolP11369 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
PolP11369 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PolP11369 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PolP11369 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
PolP11369 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PolP11369 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PolP11369 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PolP11369 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PolP11369 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PolP11369 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PolP11369 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PolP11369 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PolP11369 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PolP11369 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PolP11369 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PolP11369 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PolP11369 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PolP11369 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PolP11369 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PolP11369 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PolP11369 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PolP11369 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PolP11369 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PolP11369 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
PolP11369 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PolP11369 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PolP11369 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PolP11369 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PolP11369 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PolP11369 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PolP11369 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PolP11369 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PolP11369 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PolP11369 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PolP11369 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PolP11369 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PolP11369 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PolP11369 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PolP11369 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PolP11369 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PolP11369 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PolP11369 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PolP11369 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PolP11369 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PolP11369 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PolP11369 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PolP11369 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PolP11369 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PolP11369 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PolP11369 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PolP11369 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PolP11369 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
PolP11369 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PolP11369 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
PolP11369 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PolP11369 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
PolP11369 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
PolP11369 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
PolP11369 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PolP11369 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PolP11369 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PolP11369 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PolP11369 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PolP11369 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PolP11369 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PolP11369 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PolP11369 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PolP11369 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PolP11369 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PolP11369 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PolP11369 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PolP11369 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PolP11369 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PolP11369 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PolP11369 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PolP11369 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PolP11369 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PolP11369 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PolP11369 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PolP11369 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PolP11369 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PolP11369 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PolP11369 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PolP11369 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PolP11369 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PolP11369 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PolP11369 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PolP11369 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PolP11369 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PolP11369 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PolP11369 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PolP11369 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PolP11369 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PolP11369 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PolP11369 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PolP11369 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PolP11369 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PolP11369 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PolP11369 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PolP11369 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms