Protein–RNA interactions for Protein: P0DP43

Catspere, Cation channel sperm-associated protein subunit epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CatspereP0DP43 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CatspereP0DP43 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CatspereP0DP43 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CatspereP0DP43 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CatspereP0DP43 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CatspereP0DP43 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CatspereP0DP43 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CatspereP0DP43 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CatspereP0DP43 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CatspereP0DP43 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CatspereP0DP43 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CatspereP0DP43 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CatspereP0DP43 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CatspereP0DP43 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CatspereP0DP43 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CatspereP0DP43 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CatspereP0DP43 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CatspereP0DP43 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CatspereP0DP43 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CatspereP0DP43 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CatspereP0DP43 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CatspereP0DP43 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CatspereP0DP43 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CatspereP0DP43 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CatspereP0DP43 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
CatspereP0DP43 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CatspereP0DP43 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CatspereP0DP43 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CatspereP0DP43 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CatspereP0DP43 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CatspereP0DP43 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CatspereP0DP43 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CatspereP0DP43 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CatspereP0DP43 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CatspereP0DP43 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CatspereP0DP43 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CatspereP0DP43 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CatspereP0DP43 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CatspereP0DP43 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CatspereP0DP43 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CatspereP0DP43 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CatspereP0DP43 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CatspereP0DP43 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CatspereP0DP43 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CatspereP0DP43 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CatspereP0DP43 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
CatspereP0DP43 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
CatspereP0DP43 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
CatspereP0DP43 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
CatspereP0DP43 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CatspereP0DP43 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CatspereP0DP43 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CatspereP0DP43 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CatspereP0DP43 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CatspereP0DP43 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CatspereP0DP43 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CatspereP0DP43 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CatspereP0DP43 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CatspereP0DP43 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CatspereP0DP43 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CatspereP0DP43 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CatspereP0DP43 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CatspereP0DP43 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CatspereP0DP43 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CatspereP0DP43 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CatspereP0DP43 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CatspereP0DP43 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CatspereP0DP43 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CatspereP0DP43 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CatspereP0DP43 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CatspereP0DP43 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CatspereP0DP43 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CatspereP0DP43 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CatspereP0DP43 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CatspereP0DP43 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CatspereP0DP43 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CatspereP0DP43 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CatspereP0DP43 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CatspereP0DP43 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CatspereP0DP43 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CatspereP0DP43 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CatspereP0DP43 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CatspereP0DP43 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CatspereP0DP43 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CatspereP0DP43 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CatspereP0DP43 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CatspereP0DP43 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CatspereP0DP43 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CatspereP0DP43 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CatspereP0DP43 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CatspereP0DP43 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CatspereP0DP43 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CatspereP0DP43 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CatspereP0DP43 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CatspereP0DP43 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CatspereP0DP43 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CatspereP0DP43 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CatspereP0DP43 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CatspereP0DP43 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CatspereP0DP43 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms