Protein–RNA interactions for Protein: P08032

Spta1, Spectrin alpha chain, erythrocytic 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spta1P08032 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Spta1P08032 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Spta1P08032 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Spta1P08032 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Spta1P08032 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Spta1P08032 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Spta1P08032 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Spta1P08032 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Spta1P08032 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Spta1P08032 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Spta1P08032 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Spta1P08032 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Spta1P08032 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Spta1P08032 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Spta1P08032 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Spta1P08032 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Spta1P08032 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Spta1P08032 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Spta1P08032 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Spta1P08032 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Spta1P08032 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Spta1P08032 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Spta1P08032 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Spta1P08032 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Spta1P08032 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Spta1P08032 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Spta1P08032 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Spta1P08032 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Spta1P08032 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Spta1P08032 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Spta1P08032 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Spta1P08032 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Spta1P08032 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Spta1P08032 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Spta1P08032 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Spta1P08032 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Spta1P08032 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Spta1P08032 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Spta1P08032 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Spta1P08032 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Spta1P08032 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Spta1P08032 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Spta1P08032 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Spta1P08032 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Spta1P08032 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Spta1P08032 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Spta1P08032 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Spta1P08032 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Spta1P08032 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Spta1P08032 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Spta1P08032 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Spta1P08032 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Spta1P08032 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Spta1P08032 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Spta1P08032 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Spta1P08032 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Spta1P08032 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Spta1P08032 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Spta1P08032 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Spta1P08032 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Spta1P08032 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Spta1P08032 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Spta1P08032 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Spta1P08032 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Spta1P08032 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Spta1P08032 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Spta1P08032 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Spta1P08032 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Spta1P08032 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Spta1P08032 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Spta1P08032 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Spta1P08032 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Spta1P08032 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Spta1P08032 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Spta1P08032 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Spta1P08032 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Spta1P08032 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Spta1P08032 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Spta1P08032 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Spta1P08032 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Spta1P08032 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Spta1P08032 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Spta1P08032 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Spta1P08032 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Spta1P08032 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Spta1P08032 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Spta1P08032 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Spta1P08032 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Spta1P08032 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Spta1P08032 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Spta1P08032 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Spta1P08032 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Spta1P08032 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Spta1P08032 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Spta1P08032 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Spta1P08032 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Spta1P08032 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Spta1P08032 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Spta1P08032 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Spta1P08032 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
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