Protein–RNA interactions for Protein: P01942

Hba, Hemoglobin subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HbaP01942 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
HbaP01942 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
HbaP01942 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
HbaP01942 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
HbaP01942 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
HbaP01942 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
HbaP01942 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
HbaP01942 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
HbaP01942 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
HbaP01942 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
HbaP01942 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
HbaP01942 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
HbaP01942 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
HbaP01942 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
HbaP01942 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
HbaP01942 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HbaP01942 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
HbaP01942 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
HbaP01942 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
HbaP01942 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HbaP01942 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HbaP01942 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
HbaP01942 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HbaP01942 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HbaP01942 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HbaP01942 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HbaP01942 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
HbaP01942 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
HbaP01942 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HbaP01942 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HbaP01942 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
HbaP01942 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
HbaP01942 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HbaP01942 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HbaP01942 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
HbaP01942 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HbaP01942 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
HbaP01942 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HbaP01942 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HbaP01942 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HbaP01942 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
HbaP01942 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HbaP01942 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HbaP01942 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HbaP01942 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HbaP01942 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
HbaP01942 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HbaP01942 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HbaP01942 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HbaP01942 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HbaP01942 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
HbaP01942 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HbaP01942 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HbaP01942 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
HbaP01942 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HbaP01942 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HbaP01942 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HbaP01942 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
HbaP01942 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HbaP01942 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HbaP01942 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HbaP01942 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HbaP01942 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HbaP01942 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HbaP01942 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HbaP01942 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HbaP01942 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HbaP01942 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HbaP01942 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HbaP01942 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HbaP01942 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HbaP01942 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HbaP01942 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HbaP01942 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HbaP01942 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HbaP01942 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HbaP01942 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HbaP01942 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HbaP01942 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HbaP01942 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HbaP01942 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HbaP01942 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HbaP01942 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HbaP01942 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HbaP01942 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HbaP01942 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HbaP01942 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HbaP01942 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HbaP01942 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HbaP01942 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HbaP01942 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HbaP01942 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HbaP01942 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HbaP01942 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HbaP01942 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HbaP01942 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HbaP01942 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HbaP01942 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HbaP01942 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HbaP01942 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms