Protein–RNA interactions for Protein: P01910

H2-Aa, H-2 class II histocompatibility antigen, A-K alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-AaP01910 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
H2-AaP01910 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
H2-AaP01910 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
H2-AaP01910 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
H2-AaP01910 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
H2-AaP01910 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
H2-AaP01910 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
H2-AaP01910 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
H2-AaP01910 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
H2-AaP01910 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
H2-AaP01910 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
H2-AaP01910 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
H2-AaP01910 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
H2-AaP01910 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
H2-AaP01910 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
H2-AaP01910 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
H2-AaP01910 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
H2-AaP01910 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
H2-AaP01910 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
H2-AaP01910 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
H2-AaP01910 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
H2-AaP01910 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
H2-AaP01910 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
H2-AaP01910 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
H2-AaP01910 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
H2-AaP01910 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
H2-AaP01910 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
H2-AaP01910 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
H2-AaP01910 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
H2-AaP01910 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
H2-AaP01910 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
H2-AaP01910 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
H2-AaP01910 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
H2-AaP01910 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
H2-AaP01910 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
H2-AaP01910 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
H2-AaP01910 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
H2-AaP01910 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
H2-AaP01910 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
H2-AaP01910 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
H2-AaP01910 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
H2-AaP01910 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
H2-AaP01910 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
H2-AaP01910 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
H2-AaP01910 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
H2-AaP01910 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
H2-AaP01910 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
H2-AaP01910 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
H2-AaP01910 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
H2-AaP01910 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
H2-AaP01910 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
H2-AaP01910 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
H2-AaP01910 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
H2-AaP01910 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
H2-AaP01910 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
H2-AaP01910 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
H2-AaP01910 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
H2-AaP01910 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
H2-AaP01910 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
H2-AaP01910 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
H2-AaP01910 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
H2-AaP01910 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
H2-AaP01910 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
H2-AaP01910 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
H2-AaP01910 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
H2-AaP01910 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
H2-AaP01910 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
H2-AaP01910 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
H2-AaP01910 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
H2-AaP01910 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
H2-AaP01910 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.08
H2-AaP01910 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
H2-AaP01910 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
H2-AaP01910 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
H2-AaP01910 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
H2-AaP01910 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
H2-AaP01910 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
H2-AaP01910 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
H2-AaP01910 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
H2-AaP01910 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
H2-AaP01910 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
H2-AaP01910 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
H2-AaP01910 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
H2-AaP01910 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
H2-AaP01910 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
H2-AaP01910 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
H2-AaP01910 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
H2-AaP01910 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
H2-AaP01910 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
H2-AaP01910 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
H2-AaP01910 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
H2-AaP01910 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
H2-AaP01910 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
H2-AaP01910 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
H2-AaP01910 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
H2-AaP01910 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
H2-AaP01910 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
H2-AaP01910 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
H2-AaP01910 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
H2-AaP01910 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.7 ms