Protein–RNA interactions for Protein: P01810

Ig heavy chain V region J539, mousemouse

Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01810 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01810 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01810 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01810 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01810 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01810 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01810 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01810 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01810 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01810 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01810 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01810 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01810 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
P01810 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01810 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01810 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
P01810 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01810 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01810 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01810 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01810 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01810 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01810 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01810 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01810 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01810 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01810 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01810 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01810 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01810 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01810 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01810 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01810 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01810 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01810 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01810 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01810 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
P01810 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01810 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01810 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01810 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01810 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
P01810 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
P01810 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01810 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01810 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01810 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01810 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01810 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01810 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01810 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01810 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01810 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01810 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01810 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01810 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01810 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01810 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01810 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01810 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01810 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01810 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01810 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01810 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01810 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01810 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01810 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01810 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01810 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01810 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
P01810 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01810 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01810 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
P01810 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01810 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01810 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01810 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
P01810 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01810 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01810 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01810 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01810 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01810 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01810 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
P01810 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01810 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01810 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01810 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01810 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01810 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01810 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01810 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01810 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01810 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01810 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01810 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01810 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01810 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01810 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01810 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms