Protein–RNA interactions for Protein: P01739

T-cell receptor alpha chain V region 2B4, mousemouse

Predictions only

Length 132 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01739 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01739 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01739 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01739 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01739 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01739 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01739 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01739 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01739 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01739 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01739 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01739 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01739 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01739 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
P01739 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01739 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01739 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
P01739 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01739 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01739 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01739 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01739 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
P01739 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01739 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01739 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01739 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
P01739 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01739 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01739 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01739 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01739 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
P01739 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
P01739 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
P01739 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
P01739 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01739 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01739 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01739 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01739 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01739 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01739 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01739 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01739 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01739 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01739 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
P01739 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
P01739 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01739 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01739 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01739 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01739 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01739 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
P01739 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01739 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01739 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01739 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01739 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01739 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
P01739 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
P01739 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01739 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01739 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01739 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01739 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01739 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01739 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01739 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01739 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01739 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01739 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01739 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
P01739 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01739 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01739 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01739 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01739 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01739 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01739 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01739 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01739 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
P01739 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01739 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01739 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01739 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01739 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01739 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01739 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01739 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01739 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01739 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
P01739 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01739 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01739 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01739 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01739 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01739 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01739 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01739 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01739 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01739 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms