Protein–RNA interactions for Protein: P01648

Ig kappa chain V-V region HP 91A3, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01648 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01648 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01648 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01648 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01648 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
P01648 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01648 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01648 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01648 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01648 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01648 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01648 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01648 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01648 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01648 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01648 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01648 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01648 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01648 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01648 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01648 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01648 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01648 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01648 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
P01648 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
P01648 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01648 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01648 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01648 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01648 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01648 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01648 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01648 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01648 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01648 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01648 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01648 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01648 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01648 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01648 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01648 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01648 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01648 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01648 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01648 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01648 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01648 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01648 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01648 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01648 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01648 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01648 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01648 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01648 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01648 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01648 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01648 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01648 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01648 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01648 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01648 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01648 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01648 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01648 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01648 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01648 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
P01648 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01648 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01648 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01648 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01648 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01648 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01648 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01648 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01648 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01648 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01648 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01648 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01648 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01648 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
P01648 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01648 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01648 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01648 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
P01648 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01648 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01648 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01648 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01648 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01648 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01648 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01648 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01648 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01648 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01648 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01648 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01648 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01648 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01648 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01648 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms