Protein–RNA interactions for Protein: P01641

Ig kappa chain V-V region MOPC 173B, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01641 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
P01641 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01641 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
P01641 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
P01641 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01641 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01641 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01641 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01641 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01641 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01641 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01641 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01641 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01641 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01641 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01641 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
P01641 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01641 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01641 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01641 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01641 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01641 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01641 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01641 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01641 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01641 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01641 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01641 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01641 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
P01641 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01641 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01641 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01641 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01641 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
P01641 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01641 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01641 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
P01641 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01641 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01641 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01641 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01641 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01641 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01641 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
P01641 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01641 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01641 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01641 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01641 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01641 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01641 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01641 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01641 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01641 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01641 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
P01641 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01641 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01641 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01641 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
P01641 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
P01641 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01641 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01641 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01641 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01641 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01641 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
P01641 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01641 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01641 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01641 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01641 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01641 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01641 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01641 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01641 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01641 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01641 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01641 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01641 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01641 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01641 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01641 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
P01641 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
P01641 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
P01641 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
P01641 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01641 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01641 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01641 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01641 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01641 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01641 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01641 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01641 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01641 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01641 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01641 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01641 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01641 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01641 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.8 ms