Protein–RNA interactions for Protein: O88520

Shoc2, Leucine-rich repeat protein SHOC-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 582 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shoc2O88520 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Shoc2O88520 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Shoc2O88520 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Shoc2O88520 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Shoc2O88520 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Shoc2O88520 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Shoc2O88520 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Shoc2O88520 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Shoc2O88520 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Shoc2O88520 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Shoc2O88520 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Shoc2O88520 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Shoc2O88520 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Shoc2O88520 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Shoc2O88520 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Shoc2O88520 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Shoc2O88520 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Shoc2O88520 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Shoc2O88520 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Shoc2O88520 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Shoc2O88520 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Shoc2O88520 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Shoc2O88520 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Shoc2O88520 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Shoc2O88520 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Shoc2O88520 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Shoc2O88520 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Shoc2O88520 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Shoc2O88520 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Shoc2O88520 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Shoc2O88520 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Shoc2O88520 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Shoc2O88520 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Shoc2O88520 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Shoc2O88520 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Shoc2O88520 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Shoc2O88520 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Shoc2O88520 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Shoc2O88520 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Shoc2O88520 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Shoc2O88520 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Shoc2O88520 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Shoc2O88520 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Shoc2O88520 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Shoc2O88520 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Shoc2O88520 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Shoc2O88520 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Shoc2O88520 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Shoc2O88520 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Shoc2O88520 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Shoc2O88520 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Shoc2O88520 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Shoc2O88520 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Shoc2O88520 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Shoc2O88520 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Shoc2O88520 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Shoc2O88520 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Shoc2O88520 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Shoc2O88520 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Shoc2O88520 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Shoc2O88520 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Shoc2O88520 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Shoc2O88520 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Shoc2O88520 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Shoc2O88520 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Shoc2O88520 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Shoc2O88520 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Shoc2O88520 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Shoc2O88520 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Shoc2O88520 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Shoc2O88520 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Shoc2O88520 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Shoc2O88520 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Shoc2O88520 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Shoc2O88520 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Shoc2O88520 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Shoc2O88520 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Shoc2O88520 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Shoc2O88520 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Shoc2O88520 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Shoc2O88520 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Shoc2O88520 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Shoc2O88520 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Shoc2O88520 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Shoc2O88520 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Shoc2O88520 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Shoc2O88520 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Shoc2O88520 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Shoc2O88520 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Shoc2O88520 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Shoc2O88520 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Shoc2O88520 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Shoc2O88520 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Shoc2O88520 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Shoc2O88520 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Shoc2O88520 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Shoc2O88520 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Shoc2O88520 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Shoc2O88520 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Shoc2O88520 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms