Protein–RNA interactions for Protein: O70373

Xirp1, Xin actin-binding repeat-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xirp1O70373 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Xirp1O70373 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Xirp1O70373 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Xirp1O70373 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Xirp1O70373 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Xirp1O70373 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Xirp1O70373 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Xirp1O70373 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Xirp1O70373 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Xirp1O70373 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Xirp1O70373 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Xirp1O70373 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Xirp1O70373 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Xirp1O70373 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Xirp1O70373 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Xirp1O70373 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Xirp1O70373 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Xirp1O70373 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Xirp1O70373 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Xirp1O70373 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Xirp1O70373 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Xirp1O70373 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Xirp1O70373 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Xirp1O70373 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Xirp1O70373 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Xirp1O70373 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Xirp1O70373 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Xirp1O70373 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Xirp1O70373 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Xirp1O70373 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Xirp1O70373 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Xirp1O70373 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Xirp1O70373 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Xirp1O70373 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Xirp1O70373 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Xirp1O70373 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Xirp1O70373 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Xirp1O70373 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Xirp1O70373 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Xirp1O70373 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Xirp1O70373 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Xirp1O70373 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Xirp1O70373 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Xirp1O70373 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Xirp1O70373 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Xirp1O70373 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Xirp1O70373 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Xirp1O70373 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Xirp1O70373 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Xirp1O70373 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Xirp1O70373 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Xirp1O70373 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Xirp1O70373 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Xirp1O70373 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Xirp1O70373 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Xirp1O70373 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Xirp1O70373 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Xirp1O70373 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Xirp1O70373 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Xirp1O70373 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Xirp1O70373 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Xirp1O70373 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Xirp1O70373 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Xirp1O70373 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Xirp1O70373 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Xirp1O70373 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Xirp1O70373 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Xirp1O70373 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Xirp1O70373 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Xirp1O70373 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Xirp1O70373 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Xirp1O70373 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Xirp1O70373 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Xirp1O70373 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Xirp1O70373 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Xirp1O70373 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Xirp1O70373 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Xirp1O70373 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Xirp1O70373 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Xirp1O70373 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Xirp1O70373 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Xirp1O70373 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Xirp1O70373 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Xirp1O70373 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Xirp1O70373 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Xirp1O70373 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Xirp1O70373 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Xirp1O70373 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Xirp1O70373 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Xirp1O70373 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Xirp1O70373 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Xirp1O70373 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Xirp1O70373 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Xirp1O70373 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Xirp1O70373 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Xirp1O70373 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Xirp1O70373 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Xirp1O70373 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Xirp1O70373 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Xirp1O70373 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms