Protein–RNA interactions for Protein: O70370

Ctss, Cathepsin S, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtssO70370 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CtssO70370 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CtssO70370 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CtssO70370 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CtssO70370 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CtssO70370 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CtssO70370 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CtssO70370 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CtssO70370 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CtssO70370 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CtssO70370 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CtssO70370 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CtssO70370 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
CtssO70370 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CtssO70370 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CtssO70370 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CtssO70370 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CtssO70370 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CtssO70370 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CtssO70370 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CtssO70370 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CtssO70370 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CtssO70370 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CtssO70370 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CtssO70370 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CtssO70370 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CtssO70370 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CtssO70370 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CtssO70370 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CtssO70370 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CtssO70370 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CtssO70370 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CtssO70370 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CtssO70370 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CtssO70370 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CtssO70370 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CtssO70370 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CtssO70370 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CtssO70370 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CtssO70370 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CtssO70370 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CtssO70370 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CtssO70370 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CtssO70370 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CtssO70370 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CtssO70370 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CtssO70370 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CtssO70370 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CtssO70370 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CtssO70370 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CtssO70370 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CtssO70370 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CtssO70370 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CtssO70370 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CtssO70370 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CtssO70370 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CtssO70370 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CtssO70370 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CtssO70370 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CtssO70370 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CtssO70370 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CtssO70370 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CtssO70370 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CtssO70370 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CtssO70370 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CtssO70370 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CtssO70370 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CtssO70370 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CtssO70370 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CtssO70370 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CtssO70370 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CtssO70370 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CtssO70370 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CtssO70370 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CtssO70370 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CtssO70370 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CtssO70370 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CtssO70370 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CtssO70370 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CtssO70370 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CtssO70370 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CtssO70370 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CtssO70370 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CtssO70370 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CtssO70370 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CtssO70370 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CtssO70370 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CtssO70370 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CtssO70370 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CtssO70370 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CtssO70370 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CtssO70370 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CtssO70370 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CtssO70370 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CtssO70370 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CtssO70370 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CtssO70370 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CtssO70370 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CtssO70370 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CtssO70370 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms