Protein–RNA interactions for Protein: O55100

Syngr1, Synaptogyrin-1, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngr1O55100 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Syngr1O55100 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Syngr1O55100 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Syngr1O55100 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Syngr1O55100 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Syngr1O55100 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Syngr1O55100 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Syngr1O55100 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Syngr1O55100 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Syngr1O55100 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Syngr1O55100 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Syngr1O55100 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Syngr1O55100 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Syngr1O55100 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Syngr1O55100 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Syngr1O55100 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Syngr1O55100 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Syngr1O55100 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Syngr1O55100 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Syngr1O55100 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Syngr1O55100 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Syngr1O55100 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Syngr1O55100 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Syngr1O55100 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Syngr1O55100 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Syngr1O55100 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Syngr1O55100 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Syngr1O55100 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Syngr1O55100 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Syngr1O55100 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Syngr1O55100 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Syngr1O55100 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Syngr1O55100 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Syngr1O55100 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Syngr1O55100 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Syngr1O55100 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Syngr1O55100 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Syngr1O55100 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Syngr1O55100 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Syngr1O55100 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Syngr1O55100 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Syngr1O55100 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Syngr1O55100 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Syngr1O55100 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Syngr1O55100 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Syngr1O55100 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Syngr1O55100 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Syngr1O55100 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Syngr1O55100 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Syngr1O55100 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Syngr1O55100 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Syngr1O55100 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Syngr1O55100 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Syngr1O55100 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Syngr1O55100 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Syngr1O55100 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Syngr1O55100 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Syngr1O55100 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Syngr1O55100 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Syngr1O55100 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Syngr1O55100 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Syngr1O55100 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Syngr1O55100 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Syngr1O55100 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Syngr1O55100 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Syngr1O55100 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Syngr1O55100 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Syngr1O55100 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Syngr1O55100 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Syngr1O55100 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Syngr1O55100 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Syngr1O55100 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Syngr1O55100 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Syngr1O55100 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Syngr1O55100 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Syngr1O55100 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Syngr1O55100 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Syngr1O55100 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Syngr1O55100 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Syngr1O55100 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Syngr1O55100 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Syngr1O55100 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Syngr1O55100 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Syngr1O55100 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Syngr1O55100 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Syngr1O55100 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Syngr1O55100 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Syngr1O55100 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Syngr1O55100 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Syngr1O55100 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Syngr1O55100 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Syngr1O55100 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Syngr1O55100 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Syngr1O55100 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Syngr1O55100 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Syngr1O55100 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Syngr1O55100 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Syngr1O55100 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Syngr1O55100 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Syngr1O55100 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms