Protein–RNA interactions for Protein: O54788

Dffb, DNA fragmentation factor subunit beta, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DffbO54788 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
DffbO54788 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
DffbO54788 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
DffbO54788 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
DffbO54788 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
DffbO54788 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
DffbO54788 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
DffbO54788 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
DffbO54788 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
DffbO54788 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
DffbO54788 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
DffbO54788 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
DffbO54788 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
DffbO54788 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
DffbO54788 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
DffbO54788 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
DffbO54788 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
DffbO54788 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
DffbO54788 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
DffbO54788 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
DffbO54788 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
DffbO54788 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
DffbO54788 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
DffbO54788 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
DffbO54788 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
DffbO54788 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
DffbO54788 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
DffbO54788 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
DffbO54788 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
DffbO54788 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
DffbO54788 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
DffbO54788 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
DffbO54788 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
DffbO54788 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
DffbO54788 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
DffbO54788 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
DffbO54788 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
DffbO54788 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
DffbO54788 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
DffbO54788 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
DffbO54788 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
DffbO54788 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
DffbO54788 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
DffbO54788 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
DffbO54788 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
DffbO54788 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
DffbO54788 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
DffbO54788 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
DffbO54788 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
DffbO54788 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
DffbO54788 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
DffbO54788 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
DffbO54788 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
DffbO54788 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
DffbO54788 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
DffbO54788 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
DffbO54788 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
DffbO54788 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
DffbO54788 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
DffbO54788 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
DffbO54788 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
DffbO54788 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
DffbO54788 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
DffbO54788 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
DffbO54788 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
DffbO54788 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
DffbO54788 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
DffbO54788 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
DffbO54788 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
DffbO54788 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
DffbO54788 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
DffbO54788 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
DffbO54788 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
DffbO54788 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
DffbO54788 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
DffbO54788 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
DffbO54788 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
DffbO54788 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
DffbO54788 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
DffbO54788 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
DffbO54788 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
DffbO54788 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
DffbO54788 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
DffbO54788 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
DffbO54788 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
DffbO54788 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
DffbO54788 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
DffbO54788 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
DffbO54788 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
DffbO54788 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
DffbO54788 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
DffbO54788 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
DffbO54788 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
DffbO54788 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
DffbO54788 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
DffbO54788 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
DffbO54788 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
DffbO54788 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
DffbO54788 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
DffbO54788 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
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