Protein–RNA interactions for Protein: O35864

Cops5, COP9 signalosome complex subunit 5, mousemouse

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Length 334 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops5O35864 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cops5O35864 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Cops5O35864 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cops5O35864 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cops5O35864 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cops5O35864 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cops5O35864 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cops5O35864 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cops5O35864 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cops5O35864 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Cops5O35864 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cops5O35864 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cops5O35864 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cops5O35864 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cops5O35864 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Cops5O35864 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cops5O35864 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cops5O35864 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cops5O35864 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cops5O35864 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cops5O35864 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cops5O35864 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cops5O35864 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cops5O35864 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cops5O35864 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cops5O35864 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cops5O35864 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cops5O35864 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cops5O35864 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cops5O35864 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cops5O35864 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cops5O35864 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cops5O35864 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cops5O35864 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cops5O35864 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cops5O35864 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cops5O35864 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cops5O35864 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cops5O35864 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cops5O35864 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Cops5O35864 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cops5O35864 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cops5O35864 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cops5O35864 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cops5O35864 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cops5O35864 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cops5O35864 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cops5O35864 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cops5O35864 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cops5O35864 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cops5O35864 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cops5O35864 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cops5O35864 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cops5O35864 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cops5O35864 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cops5O35864 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cops5O35864 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cops5O35864 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cops5O35864 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cops5O35864 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cops5O35864 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Cops5O35864 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cops5O35864 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cops5O35864 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cops5O35864 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cops5O35864 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cops5O35864 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cops5O35864 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cops5O35864 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cops5O35864 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cops5O35864 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cops5O35864 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cops5O35864 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cops5O35864 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cops5O35864 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cops5O35864 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cops5O35864 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cops5O35864 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cops5O35864 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cops5O35864 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Cops5O35864 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cops5O35864 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cops5O35864 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cops5O35864 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cops5O35864 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cops5O35864 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cops5O35864 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cops5O35864 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cops5O35864 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cops5O35864 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cops5O35864 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cops5O35864 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cops5O35864 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Cops5O35864 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cops5O35864 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Cops5O35864 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cops5O35864 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Cops5O35864 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Cops5O35864 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cops5O35864 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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