Protein–RNA interactions for Protein: O35451

Atf6b, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-6 beta, mousemouse

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Length 699 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf6bO35451 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Atf6bO35451 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Atf6bO35451 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Atf6bO35451 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Atf6bO35451 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Atf6bO35451 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Atf6bO35451 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Atf6bO35451 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Atf6bO35451 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Atf6bO35451 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Atf6bO35451 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Atf6bO35451 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Atf6bO35451 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Atf6bO35451 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Atf6bO35451 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Atf6bO35451 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Atf6bO35451 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Atf6bO35451 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Atf6bO35451 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Atf6bO35451 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Atf6bO35451 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Atf6bO35451 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Atf6bO35451 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Atf6bO35451 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Atf6bO35451 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Atf6bO35451 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Atf6bO35451 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Atf6bO35451 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Atf6bO35451 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Atf6bO35451 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Atf6bO35451 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
Atf6bO35451 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Atf6bO35451 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Atf6bO35451 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Atf6bO35451 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Atf6bO35451 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Atf6bO35451 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Atf6bO35451 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Atf6bO35451 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Atf6bO35451 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Atf6bO35451 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Atf6bO35451 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Atf6bO35451 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Atf6bO35451 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Atf6bO35451 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Atf6bO35451 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Atf6bO35451 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Atf6bO35451 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Atf6bO35451 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Atf6bO35451 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Atf6bO35451 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Atf6bO35451 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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Atf6bO35451 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Atf6bO35451 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Atf6bO35451 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Atf6bO35451 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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Atf6bO35451 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Atf6bO35451 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Atf6bO35451 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
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Atf6bO35451 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Atf6bO35451 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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Atf6bO35451 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Atf6bO35451 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Atf6bO35451 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Atf6bO35451 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Atf6bO35451 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Atf6bO35451 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Atf6bO35451 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Atf6bO35451 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Atf6bO35451 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Atf6bO35451 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Atf6bO35451 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Atf6bO35451 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Atf6bO35451 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Atf6bO35451 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
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