Protein–RNA interactions for Protein: O35424

H2-Ob, Histocompatibility 2, O region beta locus, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-ObO35424 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
H2-ObO35424 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
H2-ObO35424 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
H2-ObO35424 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
H2-ObO35424 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
H2-ObO35424 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
H2-ObO35424 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
H2-ObO35424 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
H2-ObO35424 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
H2-ObO35424 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
H2-ObO35424 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
H2-ObO35424 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
H2-ObO35424 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
H2-ObO35424 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
H2-ObO35424 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
H2-ObO35424 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
H2-ObO35424 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
H2-ObO35424 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
H2-ObO35424 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
H2-ObO35424 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
H2-ObO35424 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
H2-ObO35424 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
H2-ObO35424 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
H2-ObO35424 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
H2-ObO35424 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
H2-ObO35424 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
H2-ObO35424 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
H2-ObO35424 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
H2-ObO35424 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
H2-ObO35424 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
H2-ObO35424 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
H2-ObO35424 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
H2-ObO35424 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
H2-ObO35424 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
H2-ObO35424 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
H2-ObO35424 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
H2-ObO35424 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
H2-ObO35424 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
H2-ObO35424 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
H2-ObO35424 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
H2-ObO35424 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
H2-ObO35424 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
H2-ObO35424 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
H2-ObO35424 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
H2-ObO35424 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
H2-ObO35424 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
H2-ObO35424 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
H2-ObO35424 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
H2-ObO35424 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
H2-ObO35424 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
H2-ObO35424 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
H2-ObO35424 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
H2-ObO35424 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
H2-ObO35424 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
H2-ObO35424 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
H2-ObO35424 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
H2-ObO35424 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
H2-ObO35424 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
H2-ObO35424 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
H2-ObO35424 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
H2-ObO35424 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
H2-ObO35424 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
H2-ObO35424 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
H2-ObO35424 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
H2-ObO35424 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
H2-ObO35424 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
H2-ObO35424 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
H2-ObO35424 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
H2-ObO35424 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
H2-ObO35424 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
H2-ObO35424 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
H2-ObO35424 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
H2-ObO35424 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
H2-ObO35424 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
H2-ObO35424 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
H2-ObO35424 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
H2-ObO35424 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
H2-ObO35424 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
H2-ObO35424 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
H2-ObO35424 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
H2-ObO35424 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
H2-ObO35424 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
H2-ObO35424 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
H2-ObO35424 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
H2-ObO35424 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
H2-ObO35424 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
H2-ObO35424 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
H2-ObO35424 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
H2-ObO35424 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
H2-ObO35424 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
H2-ObO35424 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
H2-ObO35424 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
H2-ObO35424 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
H2-ObO35424 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
H2-ObO35424 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
H2-ObO35424 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
H2-ObO35424 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
H2-ObO35424 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
H2-ObO35424 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
H2-ObO35424 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms