Protein–RNA interactions for Protein: O35182

Smad6, Mothers against decapentaplegic homolog 6, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad6O35182 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smad6O35182 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smad6O35182 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smad6O35182 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smad6O35182 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smad6O35182 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smad6O35182 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smad6O35182 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smad6O35182 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smad6O35182 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smad6O35182 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smad6O35182 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smad6O35182 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smad6O35182 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Smad6O35182 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Smad6O35182 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smad6O35182 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smad6O35182 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Smad6O35182 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Smad6O35182 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smad6O35182 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smad6O35182 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smad6O35182 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smad6O35182 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smad6O35182 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smad6O35182 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smad6O35182 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smad6O35182 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smad6O35182 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smad6O35182 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smad6O35182 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smad6O35182 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smad6O35182 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smad6O35182 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smad6O35182 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smad6O35182 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smad6O35182 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smad6O35182 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smad6O35182 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smad6O35182 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smad6O35182 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smad6O35182 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Smad6O35182 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smad6O35182 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smad6O35182 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Smad6O35182 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smad6O35182 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smad6O35182 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smad6O35182 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smad6O35182 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smad6O35182 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smad6O35182 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smad6O35182 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smad6O35182 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smad6O35182 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smad6O35182 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smad6O35182 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smad6O35182 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smad6O35182 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smad6O35182 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smad6O35182 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smad6O35182 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smad6O35182 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smad6O35182 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smad6O35182 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smad6O35182 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smad6O35182 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smad6O35182 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smad6O35182 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smad6O35182 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smad6O35182 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smad6O35182 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smad6O35182 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smad6O35182 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Smad6O35182 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Smad6O35182 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smad6O35182 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smad6O35182 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smad6O35182 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smad6O35182 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smad6O35182 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smad6O35182 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smad6O35182 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smad6O35182 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smad6O35182 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smad6O35182 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smad6O35182 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Smad6O35182 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Smad6O35182 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smad6O35182 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smad6O35182 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smad6O35182 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smad6O35182 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smad6O35182 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smad6O35182 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smad6O35182 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smad6O35182 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smad6O35182 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smad6O35182 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smad6O35182 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.4 ms