Protein–RNA interactions for Protein: O35134

Polr1a, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr1aO35134 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Polr1aO35134 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Polr1aO35134 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Polr1aO35134 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Polr1aO35134 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Polr1aO35134 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Polr1aO35134 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Polr1aO35134 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Polr1aO35134 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Polr1aO35134 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Polr1aO35134 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Polr1aO35134 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Polr1aO35134 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Polr1aO35134 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Polr1aO35134 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Polr1aO35134 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Polr1aO35134 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Polr1aO35134 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Polr1aO35134 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Polr1aO35134 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Polr1aO35134 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Polr1aO35134 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Polr1aO35134 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Polr1aO35134 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Polr1aO35134 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Polr1aO35134 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Polr1aO35134 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Polr1aO35134 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Polr1aO35134 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Polr1aO35134 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Polr1aO35134 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Polr1aO35134 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Polr1aO35134 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Polr1aO35134 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Polr1aO35134 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Polr1aO35134 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Polr1aO35134 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Polr1aO35134 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Polr1aO35134 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Polr1aO35134 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Polr1aO35134 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Polr1aO35134 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Polr1aO35134 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Polr1aO35134 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Polr1aO35134 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Polr1aO35134 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Polr1aO35134 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Polr1aO35134 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Polr1aO35134 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Polr1aO35134 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Polr1aO35134 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Polr1aO35134 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Polr1aO35134 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Polr1aO35134 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Polr1aO35134 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Polr1aO35134 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Polr1aO35134 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Polr1aO35134 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Polr1aO35134 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Polr1aO35134 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Polr1aO35134 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Polr1aO35134 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Polr1aO35134 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Polr1aO35134 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Polr1aO35134 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Polr1aO35134 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Polr1aO35134 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Polr1aO35134 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Polr1aO35134 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Polr1aO35134 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Polr1aO35134 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Polr1aO35134 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
Polr1aO35134 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Polr1aO35134 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Polr1aO35134 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Polr1aO35134 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Polr1aO35134 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Polr1aO35134 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Polr1aO35134 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Polr1aO35134 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Polr1aO35134 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Polr1aO35134 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Polr1aO35134 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Polr1aO35134 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Polr1aO35134 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Polr1aO35134 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Polr1aO35134 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Polr1aO35134 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Polr1aO35134 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Polr1aO35134 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Polr1aO35134 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Polr1aO35134 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Polr1aO35134 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Polr1aO35134 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Polr1aO35134 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Polr1aO35134 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Polr1aO35134 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Polr1aO35134 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Polr1aO35134 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Polr1aO35134 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms