Protein–RNA interactions for Protein: O08547

Sec22b, Vesicle-trafficking protein SEC22b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec22bO08547 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sec22bO08547 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sec22bO08547 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sec22bO08547 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sec22bO08547 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sec22bO08547 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sec22bO08547 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sec22bO08547 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sec22bO08547 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sec22bO08547 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sec22bO08547 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sec22bO08547 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sec22bO08547 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sec22bO08547 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sec22bO08547 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sec22bO08547 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Sec22bO08547 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sec22bO08547 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sec22bO08547 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sec22bO08547 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sec22bO08547 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sec22bO08547 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sec22bO08547 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sec22bO08547 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sec22bO08547 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sec22bO08547 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sec22bO08547 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sec22bO08547 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sec22bO08547 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sec22bO08547 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sec22bO08547 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sec22bO08547 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Sec22bO08547 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sec22bO08547 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sec22bO08547 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sec22bO08547 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sec22bO08547 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sec22bO08547 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sec22bO08547 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sec22bO08547 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sec22bO08547 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Sec22bO08547 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sec22bO08547 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sec22bO08547 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Sec22bO08547 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sec22bO08547 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sec22bO08547 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sec22bO08547 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sec22bO08547 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sec22bO08547 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sec22bO08547 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sec22bO08547 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sec22bO08547 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sec22bO08547 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sec22bO08547 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sec22bO08547 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sec22bO08547 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sec22bO08547 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sec22bO08547 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Sec22bO08547 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sec22bO08547 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sec22bO08547 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sec22bO08547 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sec22bO08547 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sec22bO08547 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sec22bO08547 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sec22bO08547 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Sec22bO08547 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sec22bO08547 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sec22bO08547 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sec22bO08547 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sec22bO08547 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sec22bO08547 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sec22bO08547 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sec22bO08547 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sec22bO08547 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sec22bO08547 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sec22bO08547 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sec22bO08547 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sec22bO08547 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sec22bO08547 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sec22bO08547 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sec22bO08547 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sec22bO08547 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sec22bO08547 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Sec22bO08547 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sec22bO08547 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sec22bO08547 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sec22bO08547 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sec22bO08547 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sec22bO08547 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sec22bO08547 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sec22bO08547 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sec22bO08547 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sec22bO08547 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sec22bO08547 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sec22bO08547 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sec22bO08547 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sec22bO08547 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sec22bO08547 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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