Protein–RNA interactions for Protein: L7N243

Gm20939, Predicted gene, 20939, mousemouse

Predictions only

Length 523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20939L7N243 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm20939L7N243 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm20939L7N243 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm20939L7N243 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm20939L7N243 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm20939L7N243 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm20939L7N243 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm20939L7N243 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm20939L7N243 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm20939L7N243 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm20939L7N243 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm20939L7N243 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm20939L7N243 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm20939L7N243 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm20939L7N243 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm20939L7N243 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm20939L7N243 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm20939L7N243 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm20939L7N243 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm20939L7N243 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm20939L7N243 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm20939L7N243 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm20939L7N243 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm20939L7N243 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm20939L7N243 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm20939L7N243 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm20939L7N243 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm20939L7N243 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm20939L7N243 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm20939L7N243 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm20939L7N243 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm20939L7N243 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm20939L7N243 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm20939L7N243 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm20939L7N243 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm20939L7N243 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm20939L7N243 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm20939L7N243 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm20939L7N243 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm20939L7N243 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm20939L7N243 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm20939L7N243 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm20939L7N243 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm20939L7N243 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm20939L7N243 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm20939L7N243 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm20939L7N243 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm20939L7N243 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm20939L7N243 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm20939L7N243 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm20939L7N243 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm20939L7N243 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm20939L7N243 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm20939L7N243 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm20939L7N243 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm20939L7N243 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm20939L7N243 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm20939L7N243 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm20939L7N243 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm20939L7N243 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm20939L7N243 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm20939L7N243 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm20939L7N243 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm20939L7N243 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm20939L7N243 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm20939L7N243 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm20939L7N243 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm20939L7N243 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm20939L7N243 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm20939L7N243 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm20939L7N243 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm20939L7N243 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm20939L7N243 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm20939L7N243 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm20939L7N243 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm20939L7N243 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm20939L7N243 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm20939L7N243 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm20939L7N243 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm20939L7N243 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm20939L7N243 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm20939L7N243 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm20939L7N243 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm20939L7N243 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm20939L7N243 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm20939L7N243 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm20939L7N243 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm20939L7N243 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm20939L7N243 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm20939L7N243 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm20939L7N243 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm20939L7N243 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm20939L7N243 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm20939L7N243 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm20939L7N243 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm20939L7N243 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm20939L7N243 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm20939L7N243 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm20939L7N243 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm20939L7N243 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms