Protein–RNA interactions for Protein: J3QMQ6

Gm3336, Predicted gene 3336, mousemouse

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Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3336J3QMQ6 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm3336J3QMQ6 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm3336J3QMQ6 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm3336J3QMQ6 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm3336J3QMQ6 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm3336J3QMQ6 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm3336J3QMQ6 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm3336J3QMQ6 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gm3336J3QMQ6 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gm3336J3QMQ6 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm3336J3QMQ6 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm3336J3QMQ6 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm3336J3QMQ6 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm3336J3QMQ6 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm3336J3QMQ6 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm3336J3QMQ6 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm3336J3QMQ6 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm3336J3QMQ6 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm3336J3QMQ6 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm3336J3QMQ6 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm3336J3QMQ6 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm3336J3QMQ6 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm3336J3QMQ6 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm3336J3QMQ6 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm3336J3QMQ6 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm3336J3QMQ6 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm3336J3QMQ6 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm3336J3QMQ6 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm3336J3QMQ6 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm3336J3QMQ6 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm3336J3QMQ6 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm3336J3QMQ6 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm3336J3QMQ6 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm3336J3QMQ6 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm3336J3QMQ6 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm3336J3QMQ6 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm3336J3QMQ6 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm3336J3QMQ6 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm3336J3QMQ6 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm3336J3QMQ6 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm3336J3QMQ6 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm3336J3QMQ6 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm3336J3QMQ6 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm3336J3QMQ6 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm3336J3QMQ6 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm3336J3QMQ6 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm3336J3QMQ6 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm3336J3QMQ6 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm3336J3QMQ6 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm3336J3QMQ6 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm3336J3QMQ6 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm3336J3QMQ6 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm3336J3QMQ6 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm3336J3QMQ6 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm3336J3QMQ6 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm3336J3QMQ6 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm3336J3QMQ6 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm3336J3QMQ6 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm3336J3QMQ6 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm3336J3QMQ6 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm3336J3QMQ6 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm3336J3QMQ6 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm3336J3QMQ6 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm3336J3QMQ6 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm3336J3QMQ6 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm3336J3QMQ6 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm3336J3QMQ6 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm3336J3QMQ6 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm3336J3QMQ6 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm3336J3QMQ6 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
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Gm3336J3QMQ6 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm3336J3QMQ6 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm3336J3QMQ6 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm3336J3QMQ6 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm3336J3QMQ6 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm3336J3QMQ6 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm3336J3QMQ6 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm3336J3QMQ6 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm3336J3QMQ6 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm3336J3QMQ6 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm3336J3QMQ6 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm3336J3QMQ6 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm3336J3QMQ6 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm3336J3QMQ6 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm3336J3QMQ6 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm3336J3QMQ6 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm3336J3QMQ6 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm3336J3QMQ6 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm3336J3QMQ6 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm3336J3QMQ6 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm3336J3QMQ6 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm3336J3QMQ6 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm3336J3QMQ6 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm3336J3QMQ6 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm3336J3QMQ6 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm3336J3QMQ6 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm3336J3QMQ6 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm3336J3QMQ6 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm3336J3QMQ6 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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