Protein–RNA interactions for Protein: J3QMM8

Gm7971, Predicted gene 16429, mousemouse

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Length 481 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm7971J3QMM8 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm7971J3QMM8 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm7971J3QMM8 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm7971J3QMM8 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm7971J3QMM8 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm7971J3QMM8 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm7971J3QMM8 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm7971J3QMM8 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm7971J3QMM8 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm7971J3QMM8 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm7971J3QMM8 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm7971J3QMM8 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm7971J3QMM8 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm7971J3QMM8 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm7971J3QMM8 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm7971J3QMM8 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm7971J3QMM8 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm7971J3QMM8 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm7971J3QMM8 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm7971J3QMM8 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm7971J3QMM8 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm7971J3QMM8 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm7971J3QMM8 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm7971J3QMM8 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm7971J3QMM8 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm7971J3QMM8 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Gm7971J3QMM8 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm7971J3QMM8 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm7971J3QMM8 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm7971J3QMM8 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm7971J3QMM8 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm7971J3QMM8 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Gm7971J3QMM8 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Gm7971J3QMM8 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm7971J3QMM8 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Gm7971J3QMM8 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm7971J3QMM8 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm7971J3QMM8 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm7971J3QMM8 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm7971J3QMM8 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm7971J3QMM8 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
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Gm7971J3QMM8 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Gm7971J3QMM8 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Gm7971J3QMM8 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm7971J3QMM8 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm7971J3QMM8 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm7971J3QMM8 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm7971J3QMM8 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Gm7971J3QMM8 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Gm7971J3QMM8 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm7971J3QMM8 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Gm7971J3QMM8 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Gm7971J3QMM8 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
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Gm7971J3QMM8 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Gm7971J3QMM8 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm7971J3QMM8 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm7971J3QMM8 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Gm7971J3QMM8 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm7971J3QMM8 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm7971J3QMM8 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Gm7971J3QMM8 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm7971J3QMM8 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm7971J3QMM8 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm7971J3QMM8 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm7971J3QMM8 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm7971J3QMM8 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm7971J3QMM8 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm7971J3QMM8 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm7971J3QMM8 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm7971J3QMM8 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm7971J3QMM8 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm7971J3QMM8 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm7971J3QMM8 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm7971J3QMM8 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm7971J3QMM8 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm7971J3QMM8 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm7971J3QMM8 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm7971J3QMM8 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm7971J3QMM8 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm7971J3QMM8 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm7971J3QMM8 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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