Protein–RNA interactions for Protein: J3QJW5

Cldn34c3, Claudin 34C3, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c3J3QJW5 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cldn34c3J3QJW5 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cldn34c3J3QJW5 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cldn34c3J3QJW5 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cldn34c3J3QJW5 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cldn34c3J3QJW5 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cldn34c3J3QJW5 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cldn34c3J3QJW5 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cldn34c3J3QJW5 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cldn34c3J3QJW5 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cldn34c3J3QJW5 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Cldn34c3J3QJW5 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cldn34c3J3QJW5 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cldn34c3J3QJW5 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cldn34c3J3QJW5 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Cldn34c3J3QJW5 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cldn34c3J3QJW5 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cldn34c3J3QJW5 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cldn34c3J3QJW5 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cldn34c3J3QJW5 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cldn34c3J3QJW5 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cldn34c3J3QJW5 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cldn34c3J3QJW5 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cldn34c3J3QJW5 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cldn34c3J3QJW5 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cldn34c3J3QJW5 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cldn34c3J3QJW5 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cldn34c3J3QJW5 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cldn34c3J3QJW5 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Cldn34c3J3QJW5 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Cldn34c3J3QJW5 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Cldn34c3J3QJW5 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Cldn34c3J3QJW5 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Cldn34c3J3QJW5 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Cldn34c3J3QJW5 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Cldn34c3J3QJW5 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Cldn34c3J3QJW5 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Cldn34c3J3QJW5 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Cldn34c3J3QJW5 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Cldn34c3J3QJW5 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Cldn34c3J3QJW5 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Cldn34c3J3QJW5 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Cldn34c3J3QJW5 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Cldn34c3J3QJW5 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Cldn34c3J3QJW5 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Cldn34c3J3QJW5 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Cldn34c3J3QJW5 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Cldn34c3J3QJW5 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Cldn34c3J3QJW5 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Cldn34c3J3QJW5 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Cldn34c3J3QJW5 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Cldn34c3J3QJW5 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Cldn34c3J3QJW5 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Cldn34c3J3QJW5 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Cldn34c3J3QJW5 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Cldn34c3J3QJW5 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Cldn34c3J3QJW5 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Cldn34c3J3QJW5 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Cldn34c3J3QJW5 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Cldn34c3J3QJW5 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Cldn34c3J3QJW5 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Cldn34c3J3QJW5 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Cldn34c3J3QJW5 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Cldn34c3J3QJW5 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Cldn34c3J3QJW5 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Cldn34c3J3QJW5 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Cldn34c3J3QJW5 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Cldn34c3J3QJW5 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Cldn34c3J3QJW5 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Cldn34c3J3QJW5 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Cldn34c3J3QJW5 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Cldn34c3J3QJW5 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Cldn34c3J3QJW5 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Cldn34c3J3QJW5 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Cldn34c3J3QJW5 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Cldn34c3J3QJW5 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Cldn34c3J3QJW5 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Cldn34c3J3QJW5 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Cldn34c3J3QJW5 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Cldn34c3J3QJW5 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Cldn34c3J3QJW5 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Cldn34c3J3QJW5 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Cldn34c3J3QJW5 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Cldn34c3J3QJW5 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Cldn34c3J3QJW5 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Cldn34c3J3QJW5 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Cldn34c3J3QJW5 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Cldn34c3J3QJW5 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Cldn34c3J3QJW5 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Cldn34c3J3QJW5 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Cldn34c3J3QJW5 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Cldn34c3J3QJW5 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Cldn34c3J3QJW5 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Cldn34c3J3QJW5 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Cldn34c3J3QJW5 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Cldn34c3J3QJW5 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Cldn34c3J3QJW5 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Cldn34c3J3QJW5 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Cldn34c3J3QJW5 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Cldn34c3J3QJW5 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
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