Protein–RNA interactions for Protein: G5E8V9

Arfip1, ADP-ribosylation factor-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arfip1G5E8V9 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Arfip1G5E8V9 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Arfip1G5E8V9 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Arfip1G5E8V9 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Arfip1G5E8V9 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Arfip1G5E8V9 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Arfip1G5E8V9 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Arfip1G5E8V9 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Arfip1G5E8V9 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Arfip1G5E8V9 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Arfip1G5E8V9 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Arfip1G5E8V9 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Arfip1G5E8V9 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Arfip1G5E8V9 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Arfip1G5E8V9 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Arfip1G5E8V9 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Arfip1G5E8V9 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Arfip1G5E8V9 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Arfip1G5E8V9 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Arfip1G5E8V9 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Arfip1G5E8V9 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Arfip1G5E8V9 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Arfip1G5E8V9 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Arfip1G5E8V9 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Arfip1G5E8V9 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Arfip1G5E8V9 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Arfip1G5E8V9 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Arfip1G5E8V9 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Arfip1G5E8V9 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Arfip1G5E8V9 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Arfip1G5E8V9 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Arfip1G5E8V9 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Arfip1G5E8V9 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Arfip1G5E8V9 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Arfip1G5E8V9 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Arfip1G5E8V9 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Arfip1G5E8V9 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Arfip1G5E8V9 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Arfip1G5E8V9 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Arfip1G5E8V9 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Arfip1G5E8V9 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Arfip1G5E8V9 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Arfip1G5E8V9 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Arfip1G5E8V9 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Arfip1G5E8V9 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Arfip1G5E8V9 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Arfip1G5E8V9 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Arfip1G5E8V9 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Arfip1G5E8V9 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Arfip1G5E8V9 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Arfip1G5E8V9 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Arfip1G5E8V9 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Arfip1G5E8V9 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Arfip1G5E8V9 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Arfip1G5E8V9 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Arfip1G5E8V9 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Arfip1G5E8V9 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Arfip1G5E8V9 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Arfip1G5E8V9 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Arfip1G5E8V9 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Arfip1G5E8V9 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Arfip1G5E8V9 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Arfip1G5E8V9 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Arfip1G5E8V9 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Arfip1G5E8V9 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Arfip1G5E8V9 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Arfip1G5E8V9 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Arfip1G5E8V9 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Arfip1G5E8V9 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Arfip1G5E8V9 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Arfip1G5E8V9 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Arfip1G5E8V9 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Arfip1G5E8V9 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Arfip1G5E8V9 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Arfip1G5E8V9 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Arfip1G5E8V9 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Arfip1G5E8V9 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Arfip1G5E8V9 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Arfip1G5E8V9 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Arfip1G5E8V9 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Arfip1G5E8V9 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Arfip1G5E8V9 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Arfip1G5E8V9 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Arfip1G5E8V9 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Arfip1G5E8V9 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Arfip1G5E8V9 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Arfip1G5E8V9 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Arfip1G5E8V9 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Arfip1G5E8V9 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Arfip1G5E8V9 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Arfip1G5E8V9 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Arfip1G5E8V9 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Arfip1G5E8V9 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Arfip1G5E8V9 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Arfip1G5E8V9 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Arfip1G5E8V9 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Arfip1G5E8V9 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Arfip1G5E8V9 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Arfip1G5E8V9 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Arfip1G5E8V9 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms