Protein–RNA interactions for Protein: G3X9C2

Nccrp1, F-box only protein 50, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nccrp1G3X9C2 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nccrp1G3X9C2 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nccrp1G3X9C2 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nccrp1G3X9C2 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nccrp1G3X9C2 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nccrp1G3X9C2 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nccrp1G3X9C2 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nccrp1G3X9C2 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nccrp1G3X9C2 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nccrp1G3X9C2 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nccrp1G3X9C2 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nccrp1G3X9C2 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nccrp1G3X9C2 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nccrp1G3X9C2 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nccrp1G3X9C2 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nccrp1G3X9C2 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nccrp1G3X9C2 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nccrp1G3X9C2 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nccrp1G3X9C2 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nccrp1G3X9C2 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nccrp1G3X9C2 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nccrp1G3X9C2 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nccrp1G3X9C2 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nccrp1G3X9C2 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nccrp1G3X9C2 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nccrp1G3X9C2 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nccrp1G3X9C2 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nccrp1G3X9C2 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nccrp1G3X9C2 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nccrp1G3X9C2 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nccrp1G3X9C2 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nccrp1G3X9C2 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nccrp1G3X9C2 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nccrp1G3X9C2 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nccrp1G3X9C2 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nccrp1G3X9C2 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nccrp1G3X9C2 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nccrp1G3X9C2 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nccrp1G3X9C2 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nccrp1G3X9C2 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nccrp1G3X9C2 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nccrp1G3X9C2 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nccrp1G3X9C2 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nccrp1G3X9C2 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nccrp1G3X9C2 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nccrp1G3X9C2 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nccrp1G3X9C2 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nccrp1G3X9C2 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nccrp1G3X9C2 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nccrp1G3X9C2 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nccrp1G3X9C2 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nccrp1G3X9C2 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nccrp1G3X9C2 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nccrp1G3X9C2 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nccrp1G3X9C2 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Nccrp1G3X9C2 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Nccrp1G3X9C2 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Nccrp1G3X9C2 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nccrp1G3X9C2 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nccrp1G3X9C2 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nccrp1G3X9C2 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nccrp1G3X9C2 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nccrp1G3X9C2 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nccrp1G3X9C2 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nccrp1G3X9C2 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nccrp1G3X9C2 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nccrp1G3X9C2 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nccrp1G3X9C2 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nccrp1G3X9C2 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nccrp1G3X9C2 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nccrp1G3X9C2 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nccrp1G3X9C2 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nccrp1G3X9C2 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nccrp1G3X9C2 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nccrp1G3X9C2 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nccrp1G3X9C2 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nccrp1G3X9C2 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nccrp1G3X9C2 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nccrp1G3X9C2 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nccrp1G3X9C2 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nccrp1G3X9C2 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nccrp1G3X9C2 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nccrp1G3X9C2 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nccrp1G3X9C2 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nccrp1G3X9C2 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nccrp1G3X9C2 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nccrp1G3X9C2 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nccrp1G3X9C2 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nccrp1G3X9C2 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Nccrp1G3X9C2 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nccrp1G3X9C2 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nccrp1G3X9C2 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nccrp1G3X9C2 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nccrp1G3X9C2 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nccrp1G3X9C2 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nccrp1G3X9C2 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nccrp1G3X9C2 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nccrp1G3X9C2 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nccrp1G3X9C2 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nccrp1G3X9C2 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.2 ms