Protein–RNA interactions for Protein: F8VQM8

Xntrpc, Xndc1-transient receptor potential cation channel, subfamily C, member 2 readthrough, mousemouse

Predictions only

Length 1,264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XntrpcF8VQM8 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
XntrpcF8VQM8 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
XntrpcF8VQM8 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
XntrpcF8VQM8 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
XntrpcF8VQM8 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
XntrpcF8VQM8 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
XntrpcF8VQM8 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
XntrpcF8VQM8 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
XntrpcF8VQM8 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
XntrpcF8VQM8 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
XntrpcF8VQM8 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
XntrpcF8VQM8 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
XntrpcF8VQM8 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
XntrpcF8VQM8 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
XntrpcF8VQM8 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
XntrpcF8VQM8 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
XntrpcF8VQM8 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
XntrpcF8VQM8 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
XntrpcF8VQM8 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
XntrpcF8VQM8 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
XntrpcF8VQM8 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
XntrpcF8VQM8 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
XntrpcF8VQM8 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
XntrpcF8VQM8 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
XntrpcF8VQM8 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
XntrpcF8VQM8 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
XntrpcF8VQM8 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
XntrpcF8VQM8 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
XntrpcF8VQM8 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
XntrpcF8VQM8 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
XntrpcF8VQM8 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
XntrpcF8VQM8 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
XntrpcF8VQM8 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
XntrpcF8VQM8 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
XntrpcF8VQM8 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
XntrpcF8VQM8 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
XntrpcF8VQM8 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
XntrpcF8VQM8 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
XntrpcF8VQM8 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
XntrpcF8VQM8 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
XntrpcF8VQM8 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
XntrpcF8VQM8 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
XntrpcF8VQM8 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
XntrpcF8VQM8 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
XntrpcF8VQM8 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
XntrpcF8VQM8 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
XntrpcF8VQM8 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
XntrpcF8VQM8 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
XntrpcF8VQM8 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
XntrpcF8VQM8 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
XntrpcF8VQM8 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
XntrpcF8VQM8 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
XntrpcF8VQM8 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
XntrpcF8VQM8 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
XntrpcF8VQM8 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
XntrpcF8VQM8 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
XntrpcF8VQM8 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
XntrpcF8VQM8 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
XntrpcF8VQM8 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
XntrpcF8VQM8 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
XntrpcF8VQM8 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
XntrpcF8VQM8 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
XntrpcF8VQM8 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
XntrpcF8VQM8 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
XntrpcF8VQM8 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
XntrpcF8VQM8 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
XntrpcF8VQM8 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
XntrpcF8VQM8 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
XntrpcF8VQM8 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
XntrpcF8VQM8 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
XntrpcF8VQM8 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
XntrpcF8VQM8 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
XntrpcF8VQM8 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
XntrpcF8VQM8 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
XntrpcF8VQM8 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
XntrpcF8VQM8 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
XntrpcF8VQM8 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
XntrpcF8VQM8 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
XntrpcF8VQM8 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
XntrpcF8VQM8 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
XntrpcF8VQM8 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
XntrpcF8VQM8 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
XntrpcF8VQM8 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
XntrpcF8VQM8 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
XntrpcF8VQM8 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
XntrpcF8VQM8 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
XntrpcF8VQM8 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
XntrpcF8VQM8 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
XntrpcF8VQM8 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
XntrpcF8VQM8 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
XntrpcF8VQM8 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
XntrpcF8VQM8 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
XntrpcF8VQM8 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
XntrpcF8VQM8 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
XntrpcF8VQM8 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
XntrpcF8VQM8 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
XntrpcF8VQM8 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
XntrpcF8VQM8 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
XntrpcF8VQM8 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
XntrpcF8VQM8 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.3 ms