Protein–RNA interactions for Protein: F8VQM2

Ccl26, Chemokine (C-C motif) ligand 26, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl26F8VQM2 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccl26F8VQM2 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccl26F8VQM2 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccl26F8VQM2 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccl26F8VQM2 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccl26F8VQM2 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccl26F8VQM2 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccl26F8VQM2 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccl26F8VQM2 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccl26F8VQM2 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccl26F8VQM2 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccl26F8VQM2 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccl26F8VQM2 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccl26F8VQM2 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccl26F8VQM2 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccl26F8VQM2 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccl26F8VQM2 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccl26F8VQM2 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccl26F8VQM2 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccl26F8VQM2 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccl26F8VQM2 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccl26F8VQM2 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccl26F8VQM2 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccl26F8VQM2 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccl26F8VQM2 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccl26F8VQM2 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccl26F8VQM2 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccl26F8VQM2 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccl26F8VQM2 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccl26F8VQM2 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccl26F8VQM2 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccl26F8VQM2 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccl26F8VQM2 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccl26F8VQM2 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccl26F8VQM2 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccl26F8VQM2 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccl26F8VQM2 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccl26F8VQM2 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccl26F8VQM2 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccl26F8VQM2 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccl26F8VQM2 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccl26F8VQM2 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccl26F8VQM2 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccl26F8VQM2 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccl26F8VQM2 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccl26F8VQM2 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccl26F8VQM2 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccl26F8VQM2 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccl26F8VQM2 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccl26F8VQM2 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccl26F8VQM2 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccl26F8VQM2 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccl26F8VQM2 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccl26F8VQM2 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccl26F8VQM2 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccl26F8VQM2 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccl26F8VQM2 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccl26F8VQM2 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccl26F8VQM2 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccl26F8VQM2 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccl26F8VQM2 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccl26F8VQM2 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccl26F8VQM2 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccl26F8VQM2 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccl26F8VQM2 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccl26F8VQM2 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccl26F8VQM2 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccl26F8VQM2 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccl26F8VQM2 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccl26F8VQM2 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccl26F8VQM2 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccl26F8VQM2 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccl26F8VQM2 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccl26F8VQM2 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccl26F8VQM2 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccl26F8VQM2 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccl26F8VQM2 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccl26F8VQM2 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccl26F8VQM2 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccl26F8VQM2 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccl26F8VQM2 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccl26F8VQM2 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccl26F8VQM2 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccl26F8VQM2 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccl26F8VQM2 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccl26F8VQM2 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccl26F8VQM2 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccl26F8VQM2 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccl26F8VQM2 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccl26F8VQM2 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccl26F8VQM2 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccl26F8VQM2 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccl26F8VQM2 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccl26F8VQM2 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccl26F8VQM2 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccl26F8VQM2 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccl26F8VQM2 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccl26F8VQM2 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccl26F8VQM2 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccl26F8VQM2 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms