Protein–RNA interactions for Protein: F8VPY8

Colca2, COLCA2 homolog, mousemouse

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Length 239 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Colca2F8VPY8 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Colca2F8VPY8 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Colca2F8VPY8 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Colca2F8VPY8 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Colca2F8VPY8 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Colca2F8VPY8 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Colca2F8VPY8 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Colca2F8VPY8 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Colca2F8VPY8 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Colca2F8VPY8 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Colca2F8VPY8 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Colca2F8VPY8 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Colca2F8VPY8 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Colca2F8VPY8 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Colca2F8VPY8 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Colca2F8VPY8 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Colca2F8VPY8 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Colca2F8VPY8 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Colca2F8VPY8 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Colca2F8VPY8 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Colca2F8VPY8 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Colca2F8VPY8 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Colca2F8VPY8 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Colca2F8VPY8 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Colca2F8VPY8 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Colca2F8VPY8 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Colca2F8VPY8 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Colca2F8VPY8 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Colca2F8VPY8 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Colca2F8VPY8 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Colca2F8VPY8 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Colca2F8VPY8 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Colca2F8VPY8 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Colca2F8VPY8 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Colca2F8VPY8 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Colca2F8VPY8 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Colca2F8VPY8 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Colca2F8VPY8 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Colca2F8VPY8 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Colca2F8VPY8 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Colca2F8VPY8 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Colca2F8VPY8 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Colca2F8VPY8 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Colca2F8VPY8 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Colca2F8VPY8 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Colca2F8VPY8 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Colca2F8VPY8 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Colca2F8VPY8 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Colca2F8VPY8 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Colca2F8VPY8 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Colca2F8VPY8 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Colca2F8VPY8 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Colca2F8VPY8 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Colca2F8VPY8 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Colca2F8VPY8 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Colca2F8VPY8 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Colca2F8VPY8 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Colca2F8VPY8 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Colca2F8VPY8 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Colca2F8VPY8 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Colca2F8VPY8 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Colca2F8VPY8 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Colca2F8VPY8 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Colca2F8VPY8 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Colca2F8VPY8 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Colca2F8VPY8 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Colca2F8VPY8 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Colca2F8VPY8 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Colca2F8VPY8 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Colca2F8VPY8 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Colca2F8VPY8 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Colca2F8VPY8 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Colca2F8VPY8 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Colca2F8VPY8 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Colca2F8VPY8 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Colca2F8VPY8 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Colca2F8VPY8 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Colca2F8VPY8 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Colca2F8VPY8 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Colca2F8VPY8 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Colca2F8VPY8 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Colca2F8VPY8 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Colca2F8VPY8 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Colca2F8VPY8 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Colca2F8VPY8 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Colca2F8VPY8 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Colca2F8VPY8 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Colca2F8VPY8 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Colca2F8VPY8 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Colca2F8VPY8 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Colca2F8VPY8 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Colca2F8VPY8 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Colca2F8VPY8 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Colca2F8VPY8 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Colca2F8VPY8 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Colca2F8VPY8 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Colca2F8VPY8 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Colca2F8VPY8 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Colca2F8VPY8 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Colca2F8VPY8 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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