Protein–RNA interactions for Protein: F6XS56

Gm8444, Predicted gene 8444, mousemouse

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8444F6XS56 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm8444F6XS56 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm8444F6XS56 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm8444F6XS56 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm8444F6XS56 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm8444F6XS56 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm8444F6XS56 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm8444F6XS56 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm8444F6XS56 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm8444F6XS56 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm8444F6XS56 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm8444F6XS56 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm8444F6XS56 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm8444F6XS56 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm8444F6XS56 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm8444F6XS56 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm8444F6XS56 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm8444F6XS56 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm8444F6XS56 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm8444F6XS56 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm8444F6XS56 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm8444F6XS56 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm8444F6XS56 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm8444F6XS56 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm8444F6XS56 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm8444F6XS56 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm8444F6XS56 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm8444F6XS56 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm8444F6XS56 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm8444F6XS56 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm8444F6XS56 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm8444F6XS56 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm8444F6XS56 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm8444F6XS56 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm8444F6XS56 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm8444F6XS56 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm8444F6XS56 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm8444F6XS56 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm8444F6XS56 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm8444F6XS56 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm8444F6XS56 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm8444F6XS56 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm8444F6XS56 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm8444F6XS56 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm8444F6XS56 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm8444F6XS56 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm8444F6XS56 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm8444F6XS56 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm8444F6XS56 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm8444F6XS56 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm8444F6XS56 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm8444F6XS56 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm8444F6XS56 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm8444F6XS56 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm8444F6XS56 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm8444F6XS56 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm8444F6XS56 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm8444F6XS56 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm8444F6XS56 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm8444F6XS56 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm8444F6XS56 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm8444F6XS56 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm8444F6XS56 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm8444F6XS56 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm8444F6XS56 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm8444F6XS56 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm8444F6XS56 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm8444F6XS56 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm8444F6XS56 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm8444F6XS56 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm8444F6XS56 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm8444F6XS56 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm8444F6XS56 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm8444F6XS56 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm8444F6XS56 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm8444F6XS56 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm8444F6XS56 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm8444F6XS56 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm8444F6XS56 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm8444F6XS56 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm8444F6XS56 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm8444F6XS56 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm8444F6XS56 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm8444F6XS56 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm8444F6XS56 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm8444F6XS56 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm8444F6XS56 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm8444F6XS56 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm8444F6XS56 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm8444F6XS56 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm8444F6XS56 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm8444F6XS56 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm8444F6XS56 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm8444F6XS56 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm8444F6XS56 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm8444F6XS56 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm8444F6XS56 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm8444F6XS56 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm8444F6XS56 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm8444F6XS56 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms