Protein–RNA interactions for Protein: F6RGI3

Gm340, Predicted gene 340, mousemouse

Predictions only

Length 1,242 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm340F6RGI3 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm340F6RGI3 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm340F6RGI3 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm340F6RGI3 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm340F6RGI3 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm340F6RGI3 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm340F6RGI3 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm340F6RGI3 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm340F6RGI3 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm340F6RGI3 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm340F6RGI3 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm340F6RGI3 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm340F6RGI3 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm340F6RGI3 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm340F6RGI3 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm340F6RGI3 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm340F6RGI3 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm340F6RGI3 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm340F6RGI3 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm340F6RGI3 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm340F6RGI3 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm340F6RGI3 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm340F6RGI3 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm340F6RGI3 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm340F6RGI3 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm340F6RGI3 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm340F6RGI3 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm340F6RGI3 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm340F6RGI3 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm340F6RGI3 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm340F6RGI3 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm340F6RGI3 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm340F6RGI3 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm340F6RGI3 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm340F6RGI3 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm340F6RGI3 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm340F6RGI3 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm340F6RGI3 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm340F6RGI3 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm340F6RGI3 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm340F6RGI3 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm340F6RGI3 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm340F6RGI3 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm340F6RGI3 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm340F6RGI3 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm340F6RGI3 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm340F6RGI3 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm340F6RGI3 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm340F6RGI3 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm340F6RGI3 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm340F6RGI3 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm340F6RGI3 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm340F6RGI3 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Gm340F6RGI3 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Gm340F6RGI3 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Gm340F6RGI3 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm340F6RGI3 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm340F6RGI3 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm340F6RGI3 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm340F6RGI3 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm340F6RGI3 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm340F6RGI3 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm340F6RGI3 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm340F6RGI3 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm340F6RGI3 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm340F6RGI3 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm340F6RGI3 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm340F6RGI3 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm340F6RGI3 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm340F6RGI3 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm340F6RGI3 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm340F6RGI3 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm340F6RGI3 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm340F6RGI3 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm340F6RGI3 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm340F6RGI3 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm340F6RGI3 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm340F6RGI3 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm340F6RGI3 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm340F6RGI3 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm340F6RGI3 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm340F6RGI3 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm340F6RGI3 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm340F6RGI3 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm340F6RGI3 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm340F6RGI3 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm340F6RGI3 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm340F6RGI3 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm340F6RGI3 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm340F6RGI3 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm340F6RGI3 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm340F6RGI3 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm340F6RGI3 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm340F6RGI3 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm340F6RGI3 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm340F6RGI3 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm340F6RGI3 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm340F6RGI3 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm340F6RGI3 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm340F6RGI3 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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