Protein–RNA interactions for Protein: F6Q785

Gm29094, Predicted gene 29094 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm29094F6Q785 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm29094F6Q785 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Gm29094F6Q785 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Gm29094F6Q785 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Gm29094F6Q785 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Gm29094F6Q785 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Gm29094F6Q785 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm29094F6Q785 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm29094F6Q785 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm29094F6Q785 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm29094F6Q785 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm29094F6Q785 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm29094F6Q785 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm29094F6Q785 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm29094F6Q785 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Gm29094F6Q785 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm29094F6Q785 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Gm29094F6Q785 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm29094F6Q785 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm29094F6Q785 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm29094F6Q785 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm29094F6Q785 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm29094F6Q785 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm29094F6Q785 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm29094F6Q785 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm29094F6Q785 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm29094F6Q785 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm29094F6Q785 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm29094F6Q785 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm29094F6Q785 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm29094F6Q785 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm29094F6Q785 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm29094F6Q785 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm29094F6Q785 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm29094F6Q785 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm29094F6Q785 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm29094F6Q785 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm29094F6Q785 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm29094F6Q785 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm29094F6Q785 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm29094F6Q785 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm29094F6Q785 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm29094F6Q785 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm29094F6Q785 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm29094F6Q785 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm29094F6Q785 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm29094F6Q785 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm29094F6Q785 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm29094F6Q785 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm29094F6Q785 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm29094F6Q785 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm29094F6Q785 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm29094F6Q785 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm29094F6Q785 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm29094F6Q785 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm29094F6Q785 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm29094F6Q785 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm29094F6Q785 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm29094F6Q785 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm29094F6Q785 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm29094F6Q785 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm29094F6Q785 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm29094F6Q785 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm29094F6Q785 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm29094F6Q785 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm29094F6Q785 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm29094F6Q785 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm29094F6Q785 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm29094F6Q785 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm29094F6Q785 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm29094F6Q785 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm29094F6Q785 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm29094F6Q785 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm29094F6Q785 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm29094F6Q785 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm29094F6Q785 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm29094F6Q785 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm29094F6Q785 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm29094F6Q785 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm29094F6Q785 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm29094F6Q785 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm29094F6Q785 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm29094F6Q785 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm29094F6Q785 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm29094F6Q785 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm29094F6Q785 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm29094F6Q785 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm29094F6Q785 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm29094F6Q785 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm29094F6Q785 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm29094F6Q785 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm29094F6Q785 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm29094F6Q785 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm29094F6Q785 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm29094F6Q785 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm29094F6Q785 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm29094F6Q785 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm29094F6Q785 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm29094F6Q785 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm29094F6Q785 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms