Protein–RNA interactions for Protein: F2Z3U3

Raph1, Ras association (RalGDS/AF-6) and pleckstrin homology domains 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Raph1F2Z3U3 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Raph1F2Z3U3 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Raph1F2Z3U3 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Raph1F2Z3U3 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Raph1F2Z3U3 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Raph1F2Z3U3 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Raph1F2Z3U3 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Raph1F2Z3U3 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Raph1F2Z3U3 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Raph1F2Z3U3 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Raph1F2Z3U3 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Raph1F2Z3U3 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Raph1F2Z3U3 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Raph1F2Z3U3 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Raph1F2Z3U3 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Raph1F2Z3U3 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Raph1F2Z3U3 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Raph1F2Z3U3 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Raph1F2Z3U3 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Raph1F2Z3U3 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Raph1F2Z3U3 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Raph1F2Z3U3 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Raph1F2Z3U3 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Raph1F2Z3U3 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Raph1F2Z3U3 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Raph1F2Z3U3 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Raph1F2Z3U3 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Raph1F2Z3U3 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Raph1F2Z3U3 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Raph1F2Z3U3 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Raph1F2Z3U3 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Raph1F2Z3U3 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Raph1F2Z3U3 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Raph1F2Z3U3 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Raph1F2Z3U3 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Raph1F2Z3U3 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Raph1F2Z3U3 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Raph1F2Z3U3 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Raph1F2Z3U3 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Raph1F2Z3U3 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Raph1F2Z3U3 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Raph1F2Z3U3 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Raph1F2Z3U3 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Raph1F2Z3U3 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Raph1F2Z3U3 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Raph1F2Z3U3 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Raph1F2Z3U3 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Raph1F2Z3U3 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Raph1F2Z3U3 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Raph1F2Z3U3 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Raph1F2Z3U3 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Raph1F2Z3U3 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Raph1F2Z3U3 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Raph1F2Z3U3 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Raph1F2Z3U3 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Raph1F2Z3U3 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Raph1F2Z3U3 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Raph1F2Z3U3 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Raph1F2Z3U3 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Raph1F2Z3U3 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Raph1F2Z3U3 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Raph1F2Z3U3 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Raph1F2Z3U3 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Raph1F2Z3U3 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Raph1F2Z3U3 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Raph1F2Z3U3 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Raph1F2Z3U3 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Raph1F2Z3U3 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Raph1F2Z3U3 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Raph1F2Z3U3 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Raph1F2Z3U3 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Raph1F2Z3U3 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Raph1F2Z3U3 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Raph1F2Z3U3 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Raph1F2Z3U3 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Raph1F2Z3U3 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Raph1F2Z3U3 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Raph1F2Z3U3 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Raph1F2Z3U3 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Raph1F2Z3U3 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Raph1F2Z3U3 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Raph1F2Z3U3 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Raph1F2Z3U3 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Raph1F2Z3U3 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Raph1F2Z3U3 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Raph1F2Z3U3 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Raph1F2Z3U3 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Raph1F2Z3U3 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Raph1F2Z3U3 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Raph1F2Z3U3 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Raph1F2Z3U3 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Raph1F2Z3U3 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Raph1F2Z3U3 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Raph1F2Z3U3 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Raph1F2Z3U3 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Raph1F2Z3U3 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Raph1F2Z3U3 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Raph1F2Z3U3 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Raph1F2Z3U3 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Raph1F2Z3U3 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.1 ms