Protein–RNA interactions for Protein: E9QAI8

Gm3460, Predicted gene 3460, mousemouse

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Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3460E9QAI8 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm3460E9QAI8 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm3460E9QAI8 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm3460E9QAI8 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm3460E9QAI8 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm3460E9QAI8 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm3460E9QAI8 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm3460E9QAI8 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm3460E9QAI8 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm3460E9QAI8 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm3460E9QAI8 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm3460E9QAI8 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm3460E9QAI8 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm3460E9QAI8 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm3460E9QAI8 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm3460E9QAI8 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm3460E9QAI8 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm3460E9QAI8 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm3460E9QAI8 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm3460E9QAI8 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm3460E9QAI8 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm3460E9QAI8 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm3460E9QAI8 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm3460E9QAI8 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm3460E9QAI8 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm3460E9QAI8 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm3460E9QAI8 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm3460E9QAI8 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
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Gm3460E9QAI8 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm3460E9QAI8 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm3460E9QAI8 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm3460E9QAI8 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm3460E9QAI8 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm3460E9QAI8 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm3460E9QAI8 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm3460E9QAI8 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm3460E9QAI8 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm3460E9QAI8 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gm3460E9QAI8 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gm3460E9QAI8 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gm3460E9QAI8 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gm3460E9QAI8 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm3460E9QAI8 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Gm3460E9QAI8 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm3460E9QAI8 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm3460E9QAI8 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm3460E9QAI8 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm3460E9QAI8 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm3460E9QAI8 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm3460E9QAI8 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Gm3460E9QAI8 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm3460E9QAI8 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Gm3460E9QAI8 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm3460E9QAI8 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Gm3460E9QAI8 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm3460E9QAI8 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm3460E9QAI8 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm3460E9QAI8 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Gm3460E9QAI8 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm3460E9QAI8 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm3460E9QAI8 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm3460E9QAI8 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Gm3460E9QAI8 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm3460E9QAI8 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Gm3460E9QAI8 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm3460E9QAI8 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm3460E9QAI8 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm3460E9QAI8 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm3460E9QAI8 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm3460E9QAI8 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm3460E9QAI8 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm3460E9QAI8 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm3460E9QAI8 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm3460E9QAI8 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm3460E9QAI8 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm3460E9QAI8 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm3460E9QAI8 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm3460E9QAI8 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm3460E9QAI8 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm3460E9QAI8 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm3460E9QAI8 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm3460E9QAI8 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm3460E9QAI8 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms