Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9D8

Ankrd35, Ankyrin repeat domain 35, mousemouse

Predictions only

Length 996 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd35E9Q9D8 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Ankrd35E9Q9D8 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ankrd35E9Q9D8 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ankrd35E9Q9D8 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ankrd35E9Q9D8 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ankrd35E9Q9D8 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ankrd35E9Q9D8 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ankrd35E9Q9D8 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ankrd35E9Q9D8 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ankrd35E9Q9D8 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ankrd35E9Q9D8 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ankrd35E9Q9D8 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Ankrd35E9Q9D8 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ankrd35E9Q9D8 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ankrd35E9Q9D8 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Ankrd35E9Q9D8 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ankrd35E9Q9D8 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ankrd35E9Q9D8 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ankrd35E9Q9D8 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ankrd35E9Q9D8 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ankrd35E9Q9D8 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ankrd35E9Q9D8 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ankrd35E9Q9D8 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ankrd35E9Q9D8 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ankrd35E9Q9D8 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ankrd35E9Q9D8 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ankrd35E9Q9D8 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ankrd35E9Q9D8 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ankrd35E9Q9D8 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ankrd35E9Q9D8 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ankrd35E9Q9D8 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ankrd35E9Q9D8 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ankrd35E9Q9D8 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ankrd35E9Q9D8 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ankrd35E9Q9D8 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ankrd35E9Q9D8 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ankrd35E9Q9D8 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ankrd35E9Q9D8 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ankrd35E9Q9D8 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Ankrd35E9Q9D8 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ankrd35E9Q9D8 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ankrd35E9Q9D8 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ankrd35E9Q9D8 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ankrd35E9Q9D8 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ankrd35E9Q9D8 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ankrd35E9Q9D8 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ankrd35E9Q9D8 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ankrd35E9Q9D8 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Ankrd35E9Q9D8 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Ankrd35E9Q9D8 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ankrd35E9Q9D8 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ankrd35E9Q9D8 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ankrd35E9Q9D8 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ankrd35E9Q9D8 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ankrd35E9Q9D8 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ankrd35E9Q9D8 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ankrd35E9Q9D8 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ankrd35E9Q9D8 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ankrd35E9Q9D8 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ankrd35E9Q9D8 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ankrd35E9Q9D8 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Ankrd35E9Q9D8 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ankrd35E9Q9D8 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ankrd35E9Q9D8 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ankrd35E9Q9D8 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ankrd35E9Q9D8 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ankrd35E9Q9D8 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ankrd35E9Q9D8 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ankrd35E9Q9D8 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ankrd35E9Q9D8 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ankrd35E9Q9D8 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ankrd35E9Q9D8 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ankrd35E9Q9D8 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ankrd35E9Q9D8 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ankrd35E9Q9D8 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ankrd35E9Q9D8 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ankrd35E9Q9D8 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ankrd35E9Q9D8 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ankrd35E9Q9D8 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Ankrd35E9Q9D8 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ankrd35E9Q9D8 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ankrd35E9Q9D8 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ankrd35E9Q9D8 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ankrd35E9Q9D8 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ankrd35E9Q9D8 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ankrd35E9Q9D8 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ankrd35E9Q9D8 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Ankrd35E9Q9D8 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Ankrd35E9Q9D8 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Ankrd35E9Q9D8 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Ankrd35E9Q9D8 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ankrd35E9Q9D8 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ankrd35E9Q9D8 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ankrd35E9Q9D8 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ankrd35E9Q9D8 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ankrd35E9Q9D8 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ankrd35E9Q9D8 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ankrd35E9Q9D8 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ankrd35E9Q9D8 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ankrd35E9Q9D8 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms