Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7L1

Urb2, URB2 ribosome biogenesis 2 homolog (S. cerevisiae), mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Urb2E9Q7L1 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Urb2E9Q7L1 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Urb2E9Q7L1 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Urb2E9Q7L1 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Urb2E9Q7L1 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Urb2E9Q7L1 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Urb2E9Q7L1 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Urb2E9Q7L1 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Urb2E9Q7L1 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Urb2E9Q7L1 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Urb2E9Q7L1 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Urb2E9Q7L1 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Urb2E9Q7L1 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Urb2E9Q7L1 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Urb2E9Q7L1 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Urb2E9Q7L1 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Urb2E9Q7L1 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Urb2E9Q7L1 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Urb2E9Q7L1 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Urb2E9Q7L1 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Urb2E9Q7L1 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Urb2E9Q7L1 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Urb2E9Q7L1 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Urb2E9Q7L1 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Urb2E9Q7L1 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Urb2E9Q7L1 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Urb2E9Q7L1 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Urb2E9Q7L1 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Urb2E9Q7L1 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Urb2E9Q7L1 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Urb2E9Q7L1 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Urb2E9Q7L1 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Urb2E9Q7L1 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Urb2E9Q7L1 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Urb2E9Q7L1 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Urb2E9Q7L1 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Urb2E9Q7L1 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Urb2E9Q7L1 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Urb2E9Q7L1 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Urb2E9Q7L1 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Urb2E9Q7L1 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Urb2E9Q7L1 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Urb2E9Q7L1 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Urb2E9Q7L1 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Urb2E9Q7L1 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Urb2E9Q7L1 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Urb2E9Q7L1 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Urb2E9Q7L1 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Urb2E9Q7L1 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Urb2E9Q7L1 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Urb2E9Q7L1 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Urb2E9Q7L1 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Urb2E9Q7L1 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Urb2E9Q7L1 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Urb2E9Q7L1 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Urb2E9Q7L1 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Urb2E9Q7L1 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Urb2E9Q7L1 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Urb2E9Q7L1 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Urb2E9Q7L1 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Urb2E9Q7L1 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Urb2E9Q7L1 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Urb2E9Q7L1 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Urb2E9Q7L1 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Urb2E9Q7L1 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Urb2E9Q7L1 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Urb2E9Q7L1 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Urb2E9Q7L1 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Urb2E9Q7L1 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Urb2E9Q7L1 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Urb2E9Q7L1 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Urb2E9Q7L1 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Urb2E9Q7L1 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Urb2E9Q7L1 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Urb2E9Q7L1 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Urb2E9Q7L1 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Urb2E9Q7L1 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Urb2E9Q7L1 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Urb2E9Q7L1 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Urb2E9Q7L1 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Urb2E9Q7L1 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Urb2E9Q7L1 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Urb2E9Q7L1 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Urb2E9Q7L1 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Urb2E9Q7L1 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Urb2E9Q7L1 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Urb2E9Q7L1 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Urb2E9Q7L1 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Urb2E9Q7L1 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Urb2E9Q7L1 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Urb2E9Q7L1 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Urb2E9Q7L1 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Urb2E9Q7L1 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Urb2E9Q7L1 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Urb2E9Q7L1 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Urb2E9Q7L1 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Urb2E9Q7L1 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Urb2E9Q7L1 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Urb2E9Q7L1 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Urb2E9Q7L1 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms