Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7F2

Rnf169, E3 ubiquitin-protein ligase RNF169, mousemouse

Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf169E9Q7F2 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf169E9Q7F2 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf169E9Q7F2 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf169E9Q7F2 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf169E9Q7F2 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf169E9Q7F2 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf169E9Q7F2 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf169E9Q7F2 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf169E9Q7F2 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf169E9Q7F2 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf169E9Q7F2 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf169E9Q7F2 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf169E9Q7F2 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf169E9Q7F2 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf169E9Q7F2 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf169E9Q7F2 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf169E9Q7F2 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf169E9Q7F2 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf169E9Q7F2 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf169E9Q7F2 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf169E9Q7F2 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf169E9Q7F2 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf169E9Q7F2 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf169E9Q7F2 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf169E9Q7F2 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf169E9Q7F2 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf169E9Q7F2 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf169E9Q7F2 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf169E9Q7F2 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf169E9Q7F2 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf169E9Q7F2 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf169E9Q7F2 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf169E9Q7F2 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf169E9Q7F2 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf169E9Q7F2 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf169E9Q7F2 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf169E9Q7F2 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf169E9Q7F2 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf169E9Q7F2 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf169E9Q7F2 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf169E9Q7F2 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf169E9Q7F2 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf169E9Q7F2 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf169E9Q7F2 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf169E9Q7F2 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf169E9Q7F2 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf169E9Q7F2 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf169E9Q7F2 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf169E9Q7F2 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf169E9Q7F2 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf169E9Q7F2 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf169E9Q7F2 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rnf169E9Q7F2 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rnf169E9Q7F2 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rnf169E9Q7F2 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rnf169E9Q7F2 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rnf169E9Q7F2 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rnf169E9Q7F2 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rnf169E9Q7F2 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rnf169E9Q7F2 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rnf169E9Q7F2 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rnf169E9Q7F2 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rnf169E9Q7F2 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rnf169E9Q7F2 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rnf169E9Q7F2 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rnf169E9Q7F2 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Rnf169E9Q7F2 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Rnf169E9Q7F2 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rnf169E9Q7F2 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rnf169E9Q7F2 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rnf169E9Q7F2 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rnf169E9Q7F2 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rnf169E9Q7F2 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rnf169E9Q7F2 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rnf169E9Q7F2 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rnf169E9Q7F2 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rnf169E9Q7F2 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rnf169E9Q7F2 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rnf169E9Q7F2 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rnf169E9Q7F2 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rnf169E9Q7F2 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rnf169E9Q7F2 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rnf169E9Q7F2 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rnf169E9Q7F2 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnf169E9Q7F2 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnf169E9Q7F2 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnf169E9Q7F2 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnf169E9Q7F2 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnf169E9Q7F2 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnf169E9Q7F2 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnf169E9Q7F2 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnf169E9Q7F2 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnf169E9Q7F2 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnf169E9Q7F2 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnf169E9Q7F2 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnf169E9Q7F2 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnf169E9Q7F2 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnf169E9Q7F2 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnf169E9Q7F2 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnf169E9Q7F2 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.4 ms