Protein–RNA interactions for Protein: E9Q557

Dsp, Desmoplakin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,883 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DspE9Q557 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
DspE9Q557 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
DspE9Q557 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
DspE9Q557 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
DspE9Q557 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
DspE9Q557 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
DspE9Q557 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
DspE9Q557 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
DspE9Q557 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
DspE9Q557 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
DspE9Q557 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
DspE9Q557 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
DspE9Q557 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
DspE9Q557 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
DspE9Q557 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
DspE9Q557 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
DspE9Q557 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
DspE9Q557 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
DspE9Q557 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
DspE9Q557 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
DspE9Q557 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
DspE9Q557 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
DspE9Q557 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
DspE9Q557 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
DspE9Q557 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
DspE9Q557 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
DspE9Q557 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
DspE9Q557 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
DspE9Q557 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
DspE9Q557 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
DspE9Q557 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
DspE9Q557 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
DspE9Q557 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
DspE9Q557 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
DspE9Q557 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
DspE9Q557 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
DspE9Q557 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
DspE9Q557 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
DspE9Q557 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
DspE9Q557 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
DspE9Q557 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
DspE9Q557 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
DspE9Q557 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
DspE9Q557 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
DspE9Q557 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
DspE9Q557 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
DspE9Q557 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
DspE9Q557 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
DspE9Q557 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
DspE9Q557 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
DspE9Q557 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
DspE9Q557 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
DspE9Q557 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
DspE9Q557 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
DspE9Q557 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
DspE9Q557 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
DspE9Q557 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
DspE9Q557 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
DspE9Q557 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
DspE9Q557 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DspE9Q557 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DspE9Q557 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DspE9Q557 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
DspE9Q557 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
DspE9Q557 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
DspE9Q557 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
DspE9Q557 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
DspE9Q557 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
DspE9Q557 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
DspE9Q557 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
DspE9Q557 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
DspE9Q557 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DspE9Q557 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DspE9Q557 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DspE9Q557 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DspE9Q557 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DspE9Q557 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
DspE9Q557 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DspE9Q557 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DspE9Q557 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
DspE9Q557 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
DspE9Q557 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
DspE9Q557 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
DspE9Q557 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
DspE9Q557 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
DspE9Q557 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
DspE9Q557 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
DspE9Q557 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
DspE9Q557 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
DspE9Q557 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
DspE9Q557 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
DspE9Q557 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
DspE9Q557 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
DspE9Q557 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
DspE9Q557 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
DspE9Q557 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
DspE9Q557 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
DspE9Q557 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
DspE9Q557 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
DspE9Q557 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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