Protein–RNA interactions for Protein: E9Q373

Vmn1r238, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

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Length 306 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r238E9Q373 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vmn1r238E9Q373 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vmn1r238E9Q373 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vmn1r238E9Q373 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vmn1r238E9Q373 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vmn1r238E9Q373 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vmn1r238E9Q373 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Vmn1r238E9Q373 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vmn1r238E9Q373 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vmn1r238E9Q373 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vmn1r238E9Q373 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vmn1r238E9Q373 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vmn1r238E9Q373 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vmn1r238E9Q373 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vmn1r238E9Q373 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vmn1r238E9Q373 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vmn1r238E9Q373 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vmn1r238E9Q373 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vmn1r238E9Q373 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vmn1r238E9Q373 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vmn1r238E9Q373 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Vmn1r238E9Q373 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vmn1r238E9Q373 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vmn1r238E9Q373 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Vmn1r238E9Q373 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Vmn1r238E9Q373 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vmn1r238E9Q373 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vmn1r238E9Q373 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vmn1r238E9Q373 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vmn1r238E9Q373 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vmn1r238E9Q373 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vmn1r238E9Q373 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vmn1r238E9Q373 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vmn1r238E9Q373 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vmn1r238E9Q373 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vmn1r238E9Q373 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vmn1r238E9Q373 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vmn1r238E9Q373 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Vmn1r238E9Q373 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vmn1r238E9Q373 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vmn1r238E9Q373 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vmn1r238E9Q373 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vmn1r238E9Q373 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vmn1r238E9Q373 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vmn1r238E9Q373 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vmn1r238E9Q373 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vmn1r238E9Q373 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vmn1r238E9Q373 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vmn1r238E9Q373 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vmn1r238E9Q373 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vmn1r238E9Q373 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vmn1r238E9Q373 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vmn1r238E9Q373 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vmn1r238E9Q373 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vmn1r238E9Q373 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vmn1r238E9Q373 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vmn1r238E9Q373 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vmn1r238E9Q373 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Vmn1r238E9Q373 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vmn1r238E9Q373 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vmn1r238E9Q373 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vmn1r238E9Q373 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Vmn1r238E9Q373 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vmn1r238E9Q373 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vmn1r238E9Q373 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vmn1r238E9Q373 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vmn1r238E9Q373 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vmn1r238E9Q373 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vmn1r238E9Q373 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vmn1r238E9Q373 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Vmn1r238E9Q373 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vmn1r238E9Q373 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vmn1r238E9Q373 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vmn1r238E9Q373 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vmn1r238E9Q373 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vmn1r238E9Q373 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vmn1r238E9Q373 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vmn1r238E9Q373 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Vmn1r238E9Q373 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vmn1r238E9Q373 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vmn1r238E9Q373 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vmn1r238E9Q373 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vmn1r238E9Q373 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vmn1r238E9Q373 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vmn1r238E9Q373 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vmn1r238E9Q373 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vmn1r238E9Q373 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Vmn1r238E9Q373 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vmn1r238E9Q373 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vmn1r238E9Q373 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vmn1r238E9Q373 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vmn1r238E9Q373 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vmn1r238E9Q373 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vmn1r238E9Q373 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vmn1r238E9Q373 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vmn1r238E9Q373 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vmn1r238E9Q373 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vmn1r238E9Q373 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vmn1r238E9Q373 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vmn1r238E9Q373 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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