Protein–RNA interactions for Protein: E9PZQ0

Ryr1, Ryanodine receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 5,035 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ryr1E9PZQ0 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Ryr1E9PZQ0 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Ryr1E9PZQ0 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Ryr1E9PZQ0 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Ryr1E9PZQ0 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Ryr1E9PZQ0 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Ryr1E9PZQ0 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Ryr1E9PZQ0 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Ryr1E9PZQ0 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Ryr1E9PZQ0 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Ryr1E9PZQ0 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Ryr1E9PZQ0 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Ryr1E9PZQ0 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Ryr1E9PZQ0 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
Ryr1E9PZQ0 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Ryr1E9PZQ0 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Ryr1E9PZQ0 Gm42779-201ENSMUST00000198807 406 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
Ryr1E9PZQ0 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
Ryr1E9PZQ0 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Ryr1E9PZQ0 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC9.67□□□□□ -0.86
Ryr1E9PZQ0 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
Ryr1E9PZQ0 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC9.67□□□□□ -0.86
Ryr1E9PZQ0 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Ryr1E9PZQ0 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC9.67□□□□□ -0.86
Ryr1E9PZQ0 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Ryr1E9PZQ0 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Ryr1E9PZQ0 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Ryr1E9PZQ0 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Ryr1E9PZQ0 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
Ryr1E9PZQ0 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Ryr1E9PZQ0 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
Ryr1E9PZQ0 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Ryr1E9PZQ0 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Ryr1E9PZQ0 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC9.67□□□□□ -0.86
Ryr1E9PZQ0 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC9.67□□□□□ -0.86
Ryr1E9PZQ0 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC9.67□□□□□ -0.86
Ryr1E9PZQ0 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC9.67□□□□□ -0.86
Ryr1E9PZQ0 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
Ryr1E9PZQ0 Gm11831-201ENSMUST00000141538 629 ntTSL 3 BASIC9.67□□□□□ -0.86
Ryr1E9PZQ0 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Ryr1E9PZQ0 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Ryr1E9PZQ0 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC9.67□□□□□ -0.86
Ryr1E9PZQ0 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC9.67□□□□□ -0.86
Ryr1E9PZQ0 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Ryr1E9PZQ0 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Ryr1E9PZQ0 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Ryr1E9PZQ0 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Ryr1E9PZQ0 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC9.67□□□□□ -0.86
Ryr1E9PZQ0 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Ryr1E9PZQ0 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Ryr1E9PZQ0 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Ryr1E9PZQ0 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC9.67□□□□□ -0.86
Ryr1E9PZQ0 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Ryr1E9PZQ0 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC9.67□□□□□ -0.86
Ryr1E9PZQ0 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Ryr1E9PZQ0 Gm28694-201ENSMUST00000190681 722 ntTSL 3 BASIC9.67□□□□□ -0.86
Ryr1E9PZQ0 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC9.67□□□□□ -0.86
Ryr1E9PZQ0 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Ryr1E9PZQ0 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Ryr1E9PZQ0 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Ryr1E9PZQ0 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Ryr1E9PZQ0 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC9.67□□□□□ -0.86
Ryr1E9PZQ0 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Ryr1E9PZQ0 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Ryr1E9PZQ0 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Ryr1E9PZQ0 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Ryr1E9PZQ0 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
Ryr1E9PZQ0 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Ryr1E9PZQ0 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Ryr1E9PZQ0 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Ryr1E9PZQ0 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Ryr1E9PZQ0 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Ryr1E9PZQ0 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Ryr1E9PZQ0 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Ryr1E9PZQ0 Gm12816-201ENSMUST00000118069 1212 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
Ryr1E9PZQ0 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
Ryr1E9PZQ0 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Ryr1E9PZQ0 Gm43584-201ENSMUST00000199762 605 ntTSL 3 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Ryr1E9PZQ0 Gm19640-201ENSMUST00000214849 464 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
Ryr1E9PZQ0 AC141438.2-201ENSMUST00000215068 271 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
Ryr1E9PZQ0 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
Ryr1E9PZQ0 AC135114.1-201ENSMUST00000228682 270 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
Ryr1E9PZQ0 Gm5879-201ENSMUST00000089501 1209 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
Ryr1E9PZQ0 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Ryr1E9PZQ0 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Ryr1E9PZQ0 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
Ryr1E9PZQ0 Gm10109-202ENSMUST00000206890 1211 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
Ryr1E9PZQ0 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
Ryr1E9PZQ0 Gm10109-201ENSMUST00000072123 1078 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Ryr1E9PZQ0 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Ryr1E9PZQ0 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Ryr1E9PZQ0 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
Ryr1E9PZQ0 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Ryr1E9PZQ0 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Ryr1E9PZQ0 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
Ryr1E9PZQ0 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Ryr1E9PZQ0 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Ryr1E9PZQ0 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Ryr1E9PZQ0 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Ryr1E9PZQ0 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms