Protein–RNA interactions for Protein: E9PW80

Gm3298, Predicted gene 3298, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3298E9PW80 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm3298E9PW80 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm3298E9PW80 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm3298E9PW80 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm3298E9PW80 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm3298E9PW80 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm3298E9PW80 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm3298E9PW80 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm3298E9PW80 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm3298E9PW80 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm3298E9PW80 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm3298E9PW80 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm3298E9PW80 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm3298E9PW80 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm3298E9PW80 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm3298E9PW80 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm3298E9PW80 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm3298E9PW80 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm3298E9PW80 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm3298E9PW80 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm3298E9PW80 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm3298E9PW80 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm3298E9PW80 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm3298E9PW80 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm3298E9PW80 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm3298E9PW80 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm3298E9PW80 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm3298E9PW80 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm3298E9PW80 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm3298E9PW80 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm3298E9PW80 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm3298E9PW80 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm3298E9PW80 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm3298E9PW80 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm3298E9PW80 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm3298E9PW80 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm3298E9PW80 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm3298E9PW80 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm3298E9PW80 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm3298E9PW80 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm3298E9PW80 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm3298E9PW80 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm3298E9PW80 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm3298E9PW80 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm3298E9PW80 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm3298E9PW80 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm3298E9PW80 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm3298E9PW80 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm3298E9PW80 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm3298E9PW80 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm3298E9PW80 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm3298E9PW80 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm3298E9PW80 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm3298E9PW80 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm3298E9PW80 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm3298E9PW80 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm3298E9PW80 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm3298E9PW80 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm3298E9PW80 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm3298E9PW80 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm3298E9PW80 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm3298E9PW80 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm3298E9PW80 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm3298E9PW80 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm3298E9PW80 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm3298E9PW80 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm3298E9PW80 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm3298E9PW80 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm3298E9PW80 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm3298E9PW80 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm3298E9PW80 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm3298E9PW80 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm3298E9PW80 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm3298E9PW80 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm3298E9PW80 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm3298E9PW80 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm3298E9PW80 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm3298E9PW80 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm3298E9PW80 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm3298E9PW80 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm3298E9PW80 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm3298E9PW80 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm3298E9PW80 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm3298E9PW80 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm3298E9PW80 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm3298E9PW80 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm3298E9PW80 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm3298E9PW80 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm3298E9PW80 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm3298E9PW80 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm3298E9PW80 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm3298E9PW80 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm3298E9PW80 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm3298E9PW80 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm3298E9PW80 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm3298E9PW80 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm3298E9PW80 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm3298E9PW80 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm3298E9PW80 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm3298E9PW80 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.3 ms