Protein–RNA interactions for Protein: E9PVB3

Ccdc175, Coiled-coil domain-containing protein 175, mousemouse

Predictions only

Length 822 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc175E9PVB3 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc175E9PVB3 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc175E9PVB3 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc175E9PVB3 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc175E9PVB3 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc175E9PVB3 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc175E9PVB3 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc175E9PVB3 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc175E9PVB3 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc175E9PVB3 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc175E9PVB3 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc175E9PVB3 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc175E9PVB3 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc175E9PVB3 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc175E9PVB3 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc175E9PVB3 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc175E9PVB3 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc175E9PVB3 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc175E9PVB3 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc175E9PVB3 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc175E9PVB3 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc175E9PVB3 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc175E9PVB3 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc175E9PVB3 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc175E9PVB3 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc175E9PVB3 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc175E9PVB3 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc175E9PVB3 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc175E9PVB3 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc175E9PVB3 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc175E9PVB3 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc175E9PVB3 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc175E9PVB3 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc175E9PVB3 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc175E9PVB3 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc175E9PVB3 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc175E9PVB3 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc175E9PVB3 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc175E9PVB3 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc175E9PVB3 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc175E9PVB3 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc175E9PVB3 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc175E9PVB3 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc175E9PVB3 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc175E9PVB3 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc175E9PVB3 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc175E9PVB3 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc175E9PVB3 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc175E9PVB3 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc175E9PVB3 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc175E9PVB3 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc175E9PVB3 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc175E9PVB3 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc175E9PVB3 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc175E9PVB3 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc175E9PVB3 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc175E9PVB3 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc175E9PVB3 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc175E9PVB3 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc175E9PVB3 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc175E9PVB3 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc175E9PVB3 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc175E9PVB3 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc175E9PVB3 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc175E9PVB3 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc175E9PVB3 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc175E9PVB3 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc175E9PVB3 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc175E9PVB3 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc175E9PVB3 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc175E9PVB3 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc175E9PVB3 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc175E9PVB3 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc175E9PVB3 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc175E9PVB3 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc175E9PVB3 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc175E9PVB3 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc175E9PVB3 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc175E9PVB3 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc175E9PVB3 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc175E9PVB3 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc175E9PVB3 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc175E9PVB3 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc175E9PVB3 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc175E9PVB3 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc175E9PVB3 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc175E9PVB3 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc175E9PVB3 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc175E9PVB3 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc175E9PVB3 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc175E9PVB3 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc175E9PVB3 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc175E9PVB3 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc175E9PVB3 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc175E9PVB3 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc175E9PVB3 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc175E9PVB3 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc175E9PVB3 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc175E9PVB3 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc175E9PVB3 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms